土壤微生物多样性监测-中国森林生物多样性监测网络.PDF

土壤微生物多样性监测： 揭示地下生态系统的结构和功能 土壤微生物监测专项网介绍 土壤微生物监测专项网介绍提纲 一 研究现状分析 二 专项网的总体框架 三 总体目标 四 监测网布局 五 监测指标 六 监测方式 七 近几年可能的产出 八 研究基础 一、现状分析： 土壤是一个巨大的微生物物种和基因资源库 土壤微生物资源最丰富：每克土壤10亿个微生物，但99% 微生物尚不能培养； 1克土壤中仅细菌基因就可能多达4 ×1012 或更多。 对我国土壤微生物多样性资源了解有限： 土壤中有哪些微生物物种与基因资源？其多样性分布格局与驱动 机制？ 微生物多样性监测的重要性： 是揭示生态系统功能、挖掘利用微生物菌种和基因资源的必要前 提。 一、现状分析： 微生物多样性影响生态系统的生产力与稳定性 微生物多样性与植物多样性、生态系统的功能 和过程密切相关 过量施肥带来土壤酸化、微生物多样性缺失， 导致土壤生产力下降，稳定性失衡 一、现状分析：土壤微生物多样性与植物多样性在全球地 理分布上的异同  真菌的生物地理分布模式总的来说与植物和动物类似，但有些类 群不一致；  细菌多样性受区域环境因子影响较大，在水平地带性和垂直带谱 上均与植物不同；  北美大草原的农牧业活动，使疣门菌纲菌群丰度显著降低，对难 降解碳的分解作用减弱，影响着土壤碳的稳定性。 一、现状分析：土壤微生物是驱动物质循环的生物化学发动机： 过程、强度、动态、预测、调控 碳循环 氮循环 N2 N O CO CH 2 2 4 好氧 硝酸 锰铁 甲烷 呼吸 呼吸 呼吸 氧化 氮固定 氨氧化 光合 CO2 硫酸 甲烷 作用 同化 呼吸 产生 反硝化 甲烷化产生 的生物化学发动机 一、现状分析：土壤微生物多样性监测的难点 1. 土壤微生物类群众多，并且绝大多数尚不可培养； 2. 土壤微生物个体小，难于肉眼观测，难于野外直接观测； 3. 微生物基因组组成多样，微生物过程复杂，难于同时观 测； 4. 长期以来，土壤微生物都被当做一个黑匣子，是生物多 样性监测中最薄弱的环节。 一、现状分析：环境基因组技术 近年来，随着高通量测序技术、环境基因组技术、及生物信息学技术的发展，使我们可 以从基因水平上监测不可培养微生物的群落组成和功能多样性。 高通量测序：大规模、高效率测定DNA序列。 元基因组技术 ：研究系统中的总DNA组成 元转录组技术 ：研究系统中的总RNA组成 生物信息技术 ：从海量基因组数据中解析生物学意义。 元基因组 Metagenome 元转录组 Metatranscriptome