利用表达谱芯片分析水稻籼粳交杂种优势的分子基础-南京农业大学学报.PDF

－ 　 南京农业大学学报　 ２０１５ꎬ３８(６):８８３ ８８９ ｈｔｔｐ:/ / ｎａｕｘｂ.ｎｊａｕ.ｅｄｕ.ｃｎ － 　 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｄｏｉ:１０.７６８５/ ｊ.ｉｓｓｎ.１０００ ２０３０.２０１５.０６.００２ － 牛付安ꎬ曹黎明ꎬ储黄伟ꎬ等. 利用表达谱芯片分析水稻籼粳交杂种优势的分子基础[Ｊ]. 南京农业大学学报ꎬ２０１５ꎬ３８(６):８８３ ８８９ 利用表达谱芯片分析水稻籼粳交杂种优势的分子基础 １ １ １ １ １ ２ ３ １∗ ４ 牛付安 ꎬ曹黎明 ꎬ储黄伟 ꎬ程灿 ꎬ周继华 ꎬ罗小金 ꎬ顾永平 ꎬ袁勤 ꎬ罗忠永 (１.上海市农业科学院作物育种栽培研究所ꎬ上海２０１１０６ꎻ２.复旦大学生命科学学院ꎬ上海 ２００４３３ꎻ ３.上海市崇明县良种繁育推广中心ꎬ上海２０２１５０ꎻ４.上海农科种子种苗有限公司ꎬ上海 ２０１１０６) 摘要:[目的]本文旨在研究水稻籼粳交杂种优势的分子基础ꎮ [方法]利用Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ水稻表达谱芯片分析了强优势水稻 籼粳交组合‘申９Ａ/ 繁３１’与母本‘申９Ａ’和父本‘繁３１’在幼穗分化初期剑叶组织的基因表达差异ꎬ并对差异表达基因进 行了基于生物学过程的ＧＯ(ｇｅｎｅ ｏｎｔｏｌｏｇｙ)功能分类和代谢通路分析ꎮ [结果]幼穗分化初期杂种与双亲的表型已经产生了 明显差异ꎻ共有２ ２５８个基因在杂种与亲本之间差异表达(差异倍数≥２或≤０.５)ꎬ杂种与双亲均显示差异表达的基因有 ３２７个ꎬ杂种与父本之间的差异表达基因远多于母本ꎮ 杂种差异表达基因具有多种表达模式ꎬ具有正效应基因的增强表达 和具有负效应基因的抑制表达对杂种优势均有贡献ꎮ 差异表达基因主要参与了磷代谢、运输、防卫反应以及碳水化合物代 谢等生物学过程ꎬ并在碳固定、氨基酸代谢、糖酵解/ 糖原异生以及磷酸肌醇代谢等多个代谢通路富集ꎮ [结论]水稻籼粳交 杂种优势存在复杂的分子基础ꎬ多种分子机制参与了杂种优势的形成ꎬ光合效率和光合产物运输分配效率的提高可能是杂 种优势产生的主要原因ꎮ 关键词:水稻ꎻ表达谱芯片ꎻ杂种优势ꎻ分子基础 － － － 中图分类号:Ｓ５１１.０３２　 　 　 　 文献标志码:Ａ　 　 　 　 文章编号:１０００ ２０３０(２０１５)０６ ０８８３ ０７ Ｓｔｕｄｉｅｓ ｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｂａｓｉｓ ｏｆ ｈｅｔｅｒｏｓｉｓ ｉｎ ｉｎｄｉｃａ ａｎｄｊａｐｏｎｉｃａ ｖａｒｉｅｔｉｅｓ ｉｎ ｒｉｃｅ ｂｙ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ １ １ １ １ １ ＮＩＵ Ｆｕａｎ ꎬＣＡＯ Ｌｉｍｉｎｇ ꎬＣＨＵ Ｈｕ