MiniSeq系统上的靶向重测序方案-Illumina.PDFVIP

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  • 2018-10-06 发布于天津
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MiniSeq系统上的靶向重测序方案-Illumina.PDF

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应用指南:DNA测序 ™ MiniSeq 系统上的靶向重测序方案 MiniSeq系统为靶向重测序应用带来了触手可及且经济有效的方案 要点 •• 高度集中、容易管理的研究 关注感兴趣的区域,产生更小、更容易管理的数据集 ••更高的覆盖度水平 在高的覆盖度水平实现深度测序,有助于稀有变异的鉴定 ••更低的成本和更小的数据集 降低测序成本和数据分析的负担 ••从样本到答案的时间短 与更为广泛的方法相比,缩短了周转时间 图1:靶向重测序 – MiniSeq系统上的靶向重测序实现了重点而深度的测 序,能够鉴定稀有变异。 简介 世界各地的科学家已经利用Illumina的测序和芯片技术,鉴定出成 稀有体细胞突变时,扩增子测序特别有用2,3 。无论是开展GWAS的 千上万个与疾病相关的位点。在通过全基因组关联研究(GWAS)、 后续研究,还是在牛的育种或作物选择时分析样本,抑或是开展转 全基因组测序(WGS)或全外显子组测序(WES)鉴定出宽泛的基因 化研究,用户都能靶定与他们的特定兴趣相关的基因组区域。 组区域后,他们通常开展靶向重测序(图1),以更高的深度研究更 简单而完整的流程 精确的目标区域。 MiniSeq系统为靶向重测序提供了最经济、易实现的NGS流程(图 靶向重测序带来了几个好处:它高效又经济,将新一代测序(NGS) 2)。除了定制试剂盒,您也可购买带有预选择内容的靶向重测序试 的能力集中在一组基因或基因组区域上。它以更高的覆盖度水平 剂盒。目前我们提供广泛的靶向重测序文库制备试剂盒,包括含有 进行测序,带来了几乎无限的动态范围和更高的灵敏度。靶向重测 针对癌症、心肌病、遗传疾病及其他疾病的探针组的试剂盒(表1)。 序能够发现那些通过WGS、PCR或毛细管电泳(CE)无法鉴定或鉴 定成本过高的变异。这种检测稀有变异的能力可推动新的功能变 异的鉴定,促进生物标志物的发现,或实现转化研究中临床相关靶 1 点的确定。 在发现复杂样本(如混有生殖系DNA的恶性肿瘤)中的 分析数据和 设计内容 制备文库 测序 注释变异 法 方 序 测 重 向 靶 1 天 7 小时 ‒ 1.5 天 13 ‒ 24 小时 2 小时 ® For Custom Panels Only TruSeq Amplicon Prep Kits MiniSeq System Local Run Manager-Enrichment, Nextera® Rapid Capture Prep Kits BaseSpace® Custom Amplicon Apps, ® TruSight Amplicon and Enrichment Kits BaseSpace Enrichmen

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