抗菌肽BLFcin6与不同磷脂膜之间相互作用的分子动力学模拟研究.PDF

发布日期：20 17-10-16 /cn/ch/common/create_pdf.aspx?file_nolag=1 生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biophysics 抗菌肽BLFc in6 与不同磷脂膜之间相互作用的分子 动力学模拟研究 1 ）4 ） 1 ）2 ） 1 ）3 ） 1 ）2 ） 1 ）2 ） 孔真真 赵立岭 唐 艳 王吉华 曹赞霞 ** 1）德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，山东德州 253023 ；2 ）德州学院物理与电子信息学院，山东德州 253023 ； 3 ）德州学院资源环境与规划学院，山东德州 253023 ；4 ）山东师范大学生命科学学院，山东济南 250014 ） 摘要 抗菌肽具有广谱抗菌特性，有望成为抗生素较好的替代产品.研究抗菌肽的抗菌机制，可以为新型抗菌肽的设计提 供指导.无论抗菌肽采用哪种抗菌机制，其首先要稳定地吸附到细胞膜之上.因此，本文利用分子动力学模拟方法比较了抗 菌小肽BLFcin6 与5 种不同细胞膜之间的相互作用.对这5 种细胞膜而言，小肽会很快结合在POPG 膜和DPPC-CHOL 膜 的表面，倾向于进入DPPC 膜的疏水内部，与POPC 膜和POPC-CHOL 膜的接触很少.考察相互作用能，小肽与POPG 膜 的相互作用最强，主要是小肽与细胞膜亲水头部存在静电相互作用；小肽与 DPPC 膜的疏水尾部的相互作用较强，但受 胆固醇影响，小肽只结合在DPPC-CHOL 膜表面.在结合过程中，小肽N 端的Arg 会先结合到细胞膜上，静电相互作用在 小肽锚定细胞膜的过程中起关键作用.以上研究从原子水平上解释了为什么BLFcin6 小肽具有抗菌作用，哪些残基起关键 作用，也为进一步开展BLFcin6 小肽及其衍生小肽的研究奠定基础. 关键词 BLFcin6 抗菌小肽；不同成分磷脂膜；分子动力学模拟；肽膜相互作用 学科分类号 Q615，Q7 *国家自然科学基 和山东省自然科学基 (ZR2016CQ15 和ZR20 14AL014)资助项目 **通讯联系人. Tel: 0534-8985879, E-mail: qiayilai@ 收稿日期：20 17-07-05，接受日期：20 17-10-13 物化学与生物物理进展 Prog. Biochem. Biophys. - 2 - 1 引言 抗菌肽 Antimicrobial Peptides, AMPs ）是存在于生物有机体多种多样的分泌物中的一种小分子多肽, [1] 具有广谱抗菌活性 .动植物可以利用抗菌肽来抵抗各种微生物，如细菌、真菌和病毒等.另外，抗菌肽还 [2] 可以抑制肿瘤细胞的生长、中和内毒素等 .随着致病菌的耐药性不断增强，寻找新型抗菌药物变得十分 重要.抗菌肽作为天然免疫的主要成分，具有分子量小、热稳定性高且不易产生抗药性的特点，有望成为 [3] 抗生素最好的替代产品 .抗菌肽抗菌机制研究能为新型抗菌肽的设计提供指导.近年来，抗菌肽的抗菌机 制一直是研究的热点，但目前尚未有一个理论能涵盖所有抗菌肽的作用机制.与细胞膜作用相关的抗菌机 制认为，抗菌肽穿过细胞膜后与细胞内目标特异性结合，或者在细胞膜上打孔导致细胞内容物外漏，从 [4, 5] [6] 而导致细胞死亡 . 目前提出的抗菌肽与细胞膜作用机制的模型主要有 “地毯式” carpet