草鱼羧肽酶A1基因CPA1-北京玛格泰克科技发展有限公司.PDFVIP

Online system: http://www.j 农业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2012, 20(3): 301~307 DOI: 10.3969/j .issn.1674-7968.2012.03.011 研究报告 Letter 草鱼羧肽酶A1 基因(CPA1)部分片段的单核苷酸多态性(SNP) 多态性及 其与生长性状的关联分析 1, 2 1, 2* 1 1 曹婷婷 白俊杰 于凌云 樊佳佳 1 中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东广州5 10380；2 上海海洋大学水产与生命学 院，上海20 1306 ， * 通讯作者 jjbai@ 163.net 要 羧肽酶A (EC 3.4.16) 是一类水解蛋白和多肽底物C 端芳香族氨基酸或脂肪族氨基酸残基的消化 酶。在草鱼生长相关的功能基因上研究单核苷酸多态性(SNP)与生长的相关性可为草鱼的分子辅助育种提 供依据。本研究根据草鱼(Ctenop haryngodon idella)EST-SNP 库的羧肽酶A1 基因(CPA1)重叠群的2 个Contig 扩增该 因的序列片段，采用直接测序法，经过序列比对，共筛到2 个颠换SNP 位点：C+412A 和A36C，分 别位于CPA1 基因外显子5 的34 bp 和内含子3 的36 bp 处，前者为错义突变。然后用一个群体的296 尾草 ，统计基因型频 ： 鱼对这2 个位点用SnaPshot 的方法进行检测和分型 A36C 位点的AA 基因型占26.7%， AC 基因型占52.0%，CC 基因型占21.3% 。C+412A 位点的AA 基因型占15.5%，AC 基因型占40.5% ，CC 因型占43.9% 。利用一般线性模型分析2 个SNP 位点与草鱼体质量、体长等重要生长性状的关系。关联分析 ， 结果显示 C+36A 位点不同基因型在体质量、眼间距均值上存在显著差异(P0.05) 。并且AA 基因型和CC 基因型在体质量、体长、体宽和眼间距上存在显著差异(P0.05) 。AA 基因型各项指标均值显著高于CC 基因 。 ，但是 型 C+4 12A 位点在体质量等生长性状上差异不显著(P0.05)，该位点和生长不相关 CC 基因型和AC 基因型在体重和肛前距上差异显著(P0.05)，该位点CC 基因型的6 个生长性状均值都高于AA 基因型。由 两个位点组成的5 种双倍型在体质量上存在显著差异(P0.05) 。双倍型D3 和D5 在体质量上存在差异显著 (P0.05) 。双倍型D3 和D8 在体质量、体宽、体长、体长/ 头长等生长性状上都存在显著差异(P0.05) 。D3 的 ， 。本研究结果显示 ， 各项指标均值最高 D8 的各项指标均值最低 ，可以考虑将草鱼CPA1 基因作为候选基因 用于草鱼的分子辅助育种。 关键词 草鱼，单核苷酸多态性(SNP) ，羧肽酶A1 ，基因型，生长关联分析 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Carboxypeptidase A 1 Gene (CPA1) Segments and Their Association with the Growth Traits of Grass Carp (