环境pH对褐环粘盖牛肝菌转录组的影响-广东农业科学.PDFVIP

广东农业科学… … … … … … … …2017，44（8）：47-54 Guangdong…Agricultural…Sciences…………………………………………………………………………………………………………………………………………………… doi：10.16768/j.issn.1004-874X.2017.08.008 杨威，蒋莹，陈有君，等.…环境pH对褐环粘盖牛肝菌转录组的影响［J］.广东农业科学，2017，44（8）：47-54. 环境pH对褐环粘盖牛肝菌转录组的影响 杨  威，蒋  莹，陈有君，闫  伟，李立民，霍  峰 （内蒙古农业大学生命科学学院，内蒙古…呼和浩特………010020…） 摘  要：为了探明环境酸碱条件对褐环粘盖牛肝菌基因表达的影响，测序分析了生长在不同pH环境下 的该菌转录组。结果发现，与生长在pH3环境下的菌丝相比，pH4、4.5、5、5.5、6、7、8条件下的菌丝，分别 有743、870、1…177、1…512、1…628、3…135、2…902个基因发生了差异表达，这些差异表达基因在基因本体论数 据库中分别注释到2…029、2…368、2…733、3…125、3…168、4…626、4…728个功能，在京都基因与基因组百科全书 中分别定位到76、81、108、121、116、180、177个代谢途径，其中内质网对蛋白质的加工、泛醌和其他类萜 醌的生物合成途径、谷胱甘肽代谢途径、ABC…transporter途径、色氨酸代谢途径和抗生素生物合成途径等途 径的富集程度较高。说明环境酸碱度对褐环粘盖牛肝菌蛋白质加工及物质跨膜转运等具有很大影响。 关键词：基因表达；代谢途径；褐环粘盖牛肝菌；酸碱条件 中图分类号：S646.3……………………………………………………文献标识码：A………………………………………………文章编号：1004-874X（2017）08-0047-08 Effect of environmental pH on Suillus luteus transcriptome  YANG…Wei，JIANG…Ying，CHEN…You-jun，YAN…Wei，LI…Li-min，HUO…Feng （ College of Lif e Science ，Inner Mongolia Agricultural University ，Huhhot 0 10020 ，China ） Abstract ：In…order…to…explore…the…influence…of…environmental…acid-base…conditions…on…gene…expression…of…Suillus luteus ，we…sequenced…the…transcriptome…of…the…strain…grown…in…different…pH…environment.…The…result…showed…that， compared…with…the…hyphae…grown…at…pH…3，the…hyphae…at…pH…4，4.5，5，5，5，6，7…and…8…had…743，870，1…177， 1512，1…628，3…135…and…2…902…genes…differentially…expressed…respectively.…These…differential…expressed…genes…were… respectively…annotated…to…2…029，2…368，2…733，3…125，3…168，4…626…and…4…728…functions…in…gene…ontology，and…set…to… 76，81，108，121，116，180…and…177…metabolic…pathways…in…the…Kyoto…Genome…and…Genome…Encyclopedia.…Among… them，the…degree…of…enrichment…is…higher…in…protein…processing…on…endo