裸环境下具有分子内单氢键丝氨酸分子旋光异构机理.PDFVIP

doi:10.6043/j.issn.0438-0479.201807012 裸环境下具有分子内单氢键的丝氨酸分子的 旋光异构机理 1 1* 1 2 2 1 孙大春 ，王佐成 ，高 峰 ，闫红彦 ，庄 严 ，杨晓翠 （1.白城师范学院物理学院，吉林 白城 137000；2. 白城师范学院计算机科学学院，吉林 白城137000） 摘 要：采用基于密度泛函理论的B3LYP-D3 方法和从头算的MP2 方法，在MP2/6-311++G(2df, 2pd)// ） B3LYP-D3/6-31+G(d, p)双水平对气相丝氨酸分子的旋光异构进行研究。反应通道研究表明：气相丝氨 酸分子的旋光异构反应有6 个通道a、b 、c、d、e 和f，a 和b 是羧羟基旋转接着羧基内质子转移后（b 版 还要经过R-基上的羟基旋转异构）α-氢以氨基氮为桥转移；c 和e 是羧羟基旋转后α-氢分别以氨基氮和 学 羰基氧为桥转移；d 是α-氢直接以氨基氮为桥转移；f 是α-氢以羰基氧和氨基氮联合为桥转移。势能面 科 计算表明：a 和b 通道具有优势，这两个通道的决速步能垒分别是247.37 和249.28 kJ/mol 。结果表明， 孤立的丝氨酸分子很难旋光异构。 然 关键词：丝氨酸；旋光异构；密度泛函理论；过渡态；从头算；能垒 自 中图分类号 O 641.12 文献标志码：A （ 丝氨酸(Ser)是手性氨基酸，具有左旋(S)与右旋(R)一对对映体。其左旋体与右旋体分别具有不同的 作用，S-Ser 具有合成嘌呤、胸腺嘧啶和胆碱前体的功能，R-Ser 是自然保湿因子之一, 可作为化妆品的 报 [1] [2,3] 添加剂 。已有研究 表明，R-Ser 作为其他抑制精神药物的辅助剂有改善阳性、阴性和认知症状的作 学 [4] 用。R-Ser 是哺乳动物脑内NMDA （N-methyl- R-aspartate ）受体的内源性激动剂 。 [5] 基于Ser 的重要作用，人们对它进行了大量的研究。Kedan 等 对Ser 的构象及分布进行了理论与 学 实验研究，得到了Ser 的6 种主要构象，其中含2 条和3 条分子内单氢键的Ser 分子具有很好的稳定性 大 [6] 和较高的含量分布。Bruckner 等 的研究表明，R-Ser 大量存在于前脑组织，用R-氨基酸氧化酶氧化R-Ser [7] 后，NMDA 受体调节作用减弱。黎新等 用量子化学方法计算了Ser 及其热分解过程各驻点的结构特性， 门 通过对实验结果和计算结果分析, 给出了Ser 的热分解反应机理。虽然人们对Ser 进行了比较广泛的研 厦 究，但关于它旋光异构的研究却鲜见报道。 已往研究[8-10]表明，α-丙氨酸和赖氨酸等氨基酸的旋光异构可以在α-碳上的质子以羰基氧和氨基氮 收稿日期：2018-07-07 录用日期：2018-08-19 基金项目：吉林省科技发展计划自然科学基金（20130101131JC ） *通