基于马尾松干旱转录组的抗旱功能SSR位点分析.PDFVIP

林业科学研究　２０１８，３１（５）：９ １９ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　ＤＯＩ：１０．１３２７５／ｊ．ｃｎｋｉ．ｌｙｋｘｙｊ．２０１８．０５．００２ 基于马尾松干旱转录组的抗旱功能ＳＳＲ位点分析 １，２ １ 杜明凤 ，丁贵杰 （１．贵州大学林学院，贵州省森林资源与环境研究中心，贵州 贵阳　５５００２５；２．贵州师范大学喀斯特研究院，贵州 贵阳　５５０００１） 摘要：［目的］了解马尾松干旱胁迫转录组序列的功能分布和ＳＳＲ位点分布特征，并探索与干旱关联的ＳＳＲ位点。 ［方法］对马尾松幼苗进行持续干旱胁迫，选取干旱１０、１５、２５ｄ及正常供水对照的马尾松针叶样品，通过总ＲＮＡ提 取、Ｉｌｌｕｍｉｎａ测序、ｒａｗｒｅａｄｓ去冗、Ｔｒｉｎｉｔｙ拼接获得ｕｎｉｇｅｎｅｓ。利用 Ｂｌａｓｔ比对，对 Ｕｎｉｇｅｎｅ序列进行 ＧＯ、ＫＯＧ、ＫＥＧＧ 功能注释及分类；利用Ｍｉｓａ软件进行 ＳＳＲ位点批量搜寻，ｐｒｉｍｅｒ３０软件进行规模化 ＳＳＲ引物设计；利用 ＧＯＳｅｑ （１１００）、ＫＯＢＡＳ（ｖ２０１２）软件对差异表达