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QTL-IciMapping3.0-简单教程
QTL IciMapping3.0 定位简单应用教程
张茜
中国农科院
2012.6.14
主要步骤
主要步骤
• 数据准备
• 新建project
• 导入数据
• 构建图谱
• QTL定位
准备数据
准备数据
• .map格式
将txt格式后缀名改成.map即可(表头信息
不能动),一个map文件中包括General
Information、Marker Types 、
Information for Chromosomes and
Markers三部分信息
General Information
General Information
主要更改数据:7为F2群体;1一般不动;
主要更改数据:7为F2群体;1一般不动;
选 或 均可,只要保持
Marker space type 1 2
选 或 均可,只要保持
Marker space type 1 2
数据对应
数据对应
Maker Types
Maker Types
带型统计方法
带型统计方法
Information for Chromosomes and Markers
Information for Chromosomes and Markers
这些数据是标记在第几条染色体(group)上,
这些数据是标记在第几条染色体(group)上,
未构建图谱侧全为0
未构建图谱侧全为0
新建project
新建project
点File 选New Project新建一个工作项
点File 选New Project新建一个工作项
命名
保存路径
保存路径
完成新建project
点File 选*map导入构建准备好的map格式图谱的数据--
点File 选*map导入构建准备好的map格式图谱的数据--
打开,完成数据导入
打开,完成数据导入
点击分组,
点击分组,
在此处出现group群
在此处出现group群
点 可以看到一个group下所含标记,
点 可以看到一个group下所含标记,
右键点击一个标记可以对其位置调动
右键点击一个标记可以对其位置调动
或者删除
或者删除
完成分组后,
完成分组后,
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