基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与生长性.PDFVIP

第42 卷 第 11 期 水 产 学 报 Vol. 42, No. 11 2018 年 11 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Nov., 2018 文章编号: 1000-0615(2018)11-1684-09 DOI: 10.11964/jfc.20171010987 基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与 生长性状的关联分析 * * 马冬梅 ， 全迎春， 樊佳佳， 胡 婕， 白俊杰， 刘 浩 ( 中国水产科学研究院珠江水产研究所， 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东 广州 510380) 摘要：大口黑鲈为肉食性鱼类，传统养殖过程中使用大量的冰鲜鱼为饵料，冰鲜鱼的使 用不仅增加了养殖成本，而且多余的冰鲜鱼残饵还会给环境带来严重的污染。为了保护 环境并降低养殖成本必须减少冰鲜鱼的使用量，本实验以选育适合人工配合饲料饲喂大 口黑鲈为研究目标，用人工配合饲料作为饵料驯化大口黑鲈幼鱼，在驯食后14和16 d ， 测定其体质量、全长、体高等生长指标。同时在大口黑鲈转录组测序分析获得的SNP位 点中，选择其所在序列的基因功能与能量代谢有相关性的7个SNP位点进行SNaPshot分 型，用SPSS 19.0进行卡方分析标记与生长性状的相关性。结果发现，序列Unigene 031044 中的C1332G位点、Unigene085384 中的A741G位点和Unigene022319 中的A284G位点 在体质量、全长及体高性状上存在显著差异。这3个SNP位点所在的基因经预测分别与 雌二醇17β脱氢酶12B (hsd 17b 12b)基因、长链酰基辅酶A合成酶家族成员1(acsl 1)基因和琥 珀酸脱氢酶组装因子2(sdhaf2)基因具有很高的同源性，推测上述3个SNP位点的变异可能 影响了基因表达产物对脂肪酸代谢或三羧酸循环的调节功能，与大口黑鲈对人工配合饲 料的利用能力存在密切的相关性。本研究筛选得到的与驯食相关的SNP位点为大口黑鲈 功能基因多态性的进一步研究，及加快大口黑鲈食性改良与驯化育种的遗传研究提供了 科学的参考依据。 关键词: 大口黑鲈；单核苷酸多态(SNPs) ；转录组测序(RNA-Seq) ；人工配合饲料；驯食； 生长性状 中图分类号: Q 785 ；S 965.211 文献标志码: A [3] 大口黑鲈(Micropterus salmoides)是一种淡水 程中容易腐败产生生物胺等有毒有害物质 ，比 [4] 的广温性肉食性鱼类。从20世纪80年代开始广泛 投喂人工饲料产生更多的有机污染物 。另一方 在珠江三角洲地区开展养殖生产，在“十二五”期