《利用DS软件进行顶体酶与其相应配体的对接研究》-毕业论文.docVIP

PAGE 本科毕业论文 题目： 利用DS软件进行顶体酶与其相应配体的对接研究 学 院: 医学院 专 业: 药学 学 号: 200709157037 学生姓名: 指导教师: 日 期: 二0一一年六月 摘 要 目的 顶体酶对于精子的运动和受精过程都是不可缺少的，顶体酶活力受到抑制可导致男性不育，顶体酶抑制剂的研究对于男性节育有着重要意义。利用计算机辅助药物设计（computer-aided drug design）的方法通过模拟和计算顶体酶与配体的相互作用，进行先导化合物的优化与设计。通过DS软件进行分子对接，探讨受体-配体的相互作用机制，不仅可以弥补动物药理实验方法的缺陷，也减少了人力和物力的投入，更重要的是在新药研究领域，建立了全新的理念和先进的研究手段，同时，分子对接实验研究也为一种化合物的药用意义提供直接的实验依据。南德士对顶体酶活性有较强的抑制作用，在本实验中以南德士为标准，利用计算机进行分子对接，评价目标配体化合物与顶体酶作用大小。 方法 南德士(药品代号：KF-950)是新型非甾体I类避孕新药，系世界首个通过抑制人精子顶体酶达到避孕目的的药物。应用DS软件把顶体酶与已知结构的相关配体分子进行分子对接实验，并把对接结果与南德士-顶体酶的对接结果进行相互比较，以结合的氢键作用力，对接打分，疏水作用力为评价依据，进行数据整合和比较对接结果。 结果 南德士-顶体酶在活性位点处有两种对接姿态，最佳结合姿态中含五个氢键，Libdock打分为77.8743，具有较强疏水作用力；目标配体-顶体酶在活性位点处有五种对接姿态，最佳结合姿态中含五个氢键，Libdock打分为72.6448，具有较强疏水作用力。 结论 较目标配体而言，南德士对顶体酶的活性的抑制作用更强，但二者作用相差不大。 关键词： 顶体酶； 南德士； DS； 计算机药物辅助设计（CADD）  Abstract Objective For fertilization，acrosin is essential and that acrosin activity is inhibited can lead to male infertility.The research in acrosin inhibitors is of great significance for male contraception. Computer-aided drug design method can be used for the simulation and calculation of acrosin interaction with ligands and finish the optimization of lead compounds and design. DS software with molecular docking of receptor - ligand interaction mechanism,can not only compensate the defects in animal pharmacology, but also reduce the human and material resources, What is the most important thing is the the establishment of a new concepts and advanced research methods in the field of new drug research at the same time. Experimental study of molecular docking for a medicinal compound can also provide meaningful direct experimental evidence . Methods Nan Deshi (Drug Code: KF-950) is a new Class of non-steroidal contraceptive drugs, it is the worlds first drug that inhibits the enzyme to achieve the purpose of contraceptive drugs. We use the DS software to associate acrosin with known molecular ligands in the docking experiments and the docking results will be compared