植物抗病WRKY转录因子生物信息学剖析.docVIP

植物抗病WRKY转录因子生物信息学剖析 　　摘要：以GenBank上登录的拟南芥（Arabidopsis thaliana）、欧芹（Petroselinum crispum）、辣椒（Capsicum annuum L.）、水稻（Oryza sativa L.）和毛白杨（Populus tomentosa）的22个WRKY家族抗病转录因子为分析对象，采用生物信息学方法对其系统发生树、保守基序和蛋白质三级结构进行分析。结果表明，22个抗病WRKY转录因子分为2个大类群，7个亚类群。两大类群的转录因子都具有基序1和2，系统发育树中第一大类群中的拟南芥AtWRKY4和AtWRKY25，欧芹PcWRKY1和辣椒CaWRKY-a具有相似的蛋白质三级结构，其都具有基序9和基序12，拟南芥AtWRKY33和AtWRKY48具有相似的蛋白质三级结构，都具有基序18；系统发育树中第四亚类群中的辣椒CaWRKY1和毛白杨PtWRKY23，具有相似的蛋白质三级结构。 　　关键词：植物；WRKY转录因子；抗病；生物信息学 　　中图分类号：S718.46；Q7 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2014）05-1191-05 　　植物在长期进化过程中形成了一系列机制，以适应和抵御各种生物和非生物逆境，在众多的适应性机制中，基因表达的转录调节在植物应答环境信号刺激反应过程中起着重要作用。转