GenBank记录中特性表中的限定词-重庆医科大学图书馆.PPT

通过基因名称检索基因或基因编码产物的功能 “ras”[GENE] 通过基因名称检索基因或基因编码产物的功能 通过基因名称检索基因或基因编码产物的功能 如何检索基因或基因编码产物的功能： 1 2 基因名称 序列接受号 NM_001126 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 序列接受号为NM_001126的核酸序列的GenBank格式 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 通过序列接受号检索基因或基因编码产物的功能 如何检索基因或基因编码产物的功能： 1 2 3 基因名称 序列接受号 序 列 通过序列检索基因或基因编码产物的功能 通过序列检索基因或基因编码产物的功能 谢 谢！ Entrez高级检索功能：索引检索 序列特性关键词索引 Entrez高级检索功能：索引检索 序列特性关键词索引 Entrez高级检索功能：索引检索 Entrez高级检索功能：索引检索 Entrez高级检索功能：索引检索 “ras” Entrez高级检索功能：索引检索 “ras” Entrez高级检索功能：索引检索 (“promoter”[Feature key])AND “ras”[Gene Name] (“promoter”[Feature key])AND “ras”[Gene Name] Entrez高级检索功能：索引检索 GenBank数据库 1 2 简 介 Entrez检索功能 1. 检索界面 基本检索功能 高级检索功能 检索结果的显示 检索结果的显示 检索结果的显示 序列特性表 检索结果的显示 关键词 解 释 关键词 解 释 misc_feature 生物学特性无法用特性表关键词描述的序列 promoter 转录起始区 misc_difference 序列特性无法用特性表关键词描述的序列 CAAT_signal 真核启动子上游的CAAT盒,与RNA结合相关 conflict 同一序列在不同的研究中在位点或区域上有差异 TATA_signal 真核启动子的TATA盒 unsure 序列不能确定的区域 -35_signal 原核启动子中的-35框 old_sequence 该序列对以前的版本做过修订 -10_signal 原核启动子的Pribow盒 variation 包含稳定突变的序列 GC_signal 真核启动子的GC盒 modified_base 修饰过的核苷酸 RBS 核糖体结合位点 gene 已识别为基因或已命名的序列区域 polyA_signal RNA转录本的剪切识别位点 misc_signal 无法用信号特性关键词描述的信号序列 enhancer 增强子 GenBank记录中特性表中的主要关键词: 关键词 解 释 关键词 解 释 attenuator 与转录终止有关的序列 CDS 蛋白质编码序列 terminator 转录终止序列 sig_peptide 编码信号肽的序列 rep_origin 双链DNA复制起始区 transit_peptide 转运蛋白编码序列 misc_RNA 无法用RNA关键词描述的转录物或RNA产物 mat_peptide 编码成熟肽的序列 prim_transcript 初始转录本 intron 内含子 precursor_RNA 前体RNA polyA_site RNA转录本的多聚腺苷酸化位点 mRNA 信使RNA rRNA 核糖体RNA 5’clip 前体转录本中被剪切掉的5’端序列 tRNA 转运RNA 3’ clip 前体转录本中被剪切掉的3’端序列 scRNA 小细胞质RNA 5’UTR 5’非翻译区 snRNA 小核RNA 3’UTR 3’非翻译区 snoRNA 加工和修饰rRNA的小核RNA exon 外显子 GenBank记录中特性表中的主要关键词: 关键词 解 释 关键词 解 释 immunoglobulin_related repeat_unit 单个的重复元件 C_region 免疫相关蛋白上的不变区 LTR 长末端重复序列 D_segment 免疫球蛋白重链的可变区，T细胞受体β链 Satellite 卫星重复序列 J_ segment 免疫球蛋白重链、轻链以及T细胞α、β、γ的结合链 misc_binding 无法描述的核酸序列结合位点 N_ region 插入重排免疫球蛋白片段间的核苷酸 primer_bin