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分子遗传学基因分析在Avellino角膜营养不良一家系的应用-药理学专业论文
安徽医
安徽医科大学硕士学位论文
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英文缩略词表
英文缩写 英文名称 中文译名
CDGG-I corneal dystrophy 颗粒性角膜营养不良
Reis-Bucklers corneal dystrophy Reis—Bucklers 角膜营养
RBCD
不良
GCD-II Avellino corneal dystrophy Avellino 角膜营养不良
CDL Lattice corneal dystrophy 晶格状角膜营养不良
bp Base pair 碱基对
TGFBI
transforming growth factor-beta
-induced gene
转化生长因子 β 诱导基
因
DNA Deoxyribonucleic acid 脱氧核糖核酸
dNTP deoxynucleotide 脱氧核糖核酸酶
EB Ethidium bromide 溴化乙锭
EDTA Ethylenediamine tetraacetic acid 乙二胺四乙酸
Synonymous single nucleotide polymorphisms 同义单核苷酸多态性
SNP
A Adenine 腺嘌呤
C Cytosine 胞嘧啶
T Thymine bases 胸腺嘧啶
G Guanine 鸟嘌呤
M/L Mole per liter 摩尔/升
mM/L Mill mole per liter 毫摩尔/升
mm millimeter 毫米
μl microliter 微升
PKa Acid dissociation constant logarithmic 酸度系数对数
PCR Polymerase chain reaction 聚合酶链反应
Thiel-Behnke corneal dystrophy Thiel-Behnke 角膜营养
CDTB
不良
r/min Revolution per minute 转/分钟
STS Sequence tagged site 序列标记位点
TE Tris. Cl-EDTA buffer TE 缓冲液
Tris Hydroxymethyl aminomethans 三羟甲基氨基甲烷
分子遗传学基因研究在 Avellino 角膜营养不良一家系
的应用
摘要
背景 角膜营养不良(corneal dystrophy)是一种少见的眼科遗传病, 会导致严重 的视力损害。角膜营养不良分为很多类型,其中研究的最多的是与TGFBI基因相关 的角膜营养不良,多为常染色体显性遗传病,研究表明TGFBI基因即转化生长因子 β诱导突变基因,位于染色体5q31上, TGFBI(BIGH-3)相关的角膜营养不良包括典 型颗粒性角膜营养不良(GCD,CDGG-I)与晶格状角膜营养不良(CDL),Avellino 角膜营养不良(GCD-II), Reis—Bucklers角膜营养不良(Reis-Bucklers corneal dystrophy,RBCD) ,Avellino角膜营养不良(Avellino corneal dystrophy)其 发病较早,外显率高,可90%,男性与女性患病率无显著差别。
目的 对角膜营养不良一家系进行临床眼科检查及分子遗传学分析和分类,了解其 家系是否存在TGFBI基因突变及TGFBI基因的突变类型。
方法 收集1个临床诊断为Avellino角膜营养不良的家系,家系中4名为角膜营养不 良患者, 2名为表型正常成员,50名健康人群为对照。对所有参加实验的实验对象 进行详细视力检查,病史询问和裂隙灯显微镜检查,并抽取外周血5 m1置于EDTA 抗凝真空采血管中。使用血液基因组DNA提取试剂提取血液DNA。后设计TGFBI 基因所有17个外显子的特异性引物,利用17个特异性引物进行聚合酶链反应扩增 目的片段,对PCR反应产物行DNA测序,将测序结果和GenBank进行比对并分析。 结果 该角膜营养不良家系4名患者裂隙灯显微镜检查显示中央角膜基质浅层均有 雪花状,盘状,结晶状,杆状角膜混浊,混浊间隙及周边角膜透明。4名患者TGFBI 基因第4号外显子存在CGCCAC(R124H)杂合突变,而家系表现正常成员及50名正 常对照无此基因位点突变。同时4名患病家庭成员均存在同义单核苷酸多态性 (SNP):第11号外显子杂合性的CTCCTT(L472L),3名患者第12外显子杂合性的
TTTTTC (F540F) 一名患者为纯合性的TTTTTC (F540F),一名家系表现正常成
员存在该位点杂合同义SNP,另一名家系表现正常成员及50名正常对照无该位点杂 合同义SNP。
结论 通过分子遗传学方法明确该角膜营养不良家系存在TGFBI基因突变,为 R124H杂合
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