水产动物的病毒基因组及其病毒与宿主的相互作用-生物通.PDFVIP

中国科学: 生命科学 2014 年 第44 卷 第12 期: 1236 ~ 1252 SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS 评 述 鱼类生物学和生物技术专辑 水产动物的病毒基因组及其病毒与宿主的 相互作用 张奇亚, 桂建芳 中国科学院水生生物研究所, 淡水生态与生物技术国家重点实验室, 武汉 430072 E-mail: zhangqy@ 收稿日期: 2014-09-15; 接受日期: 2014-10-29 国家自然科学基金(批准号:、国家重点基础研究发展计划(批准号: 2010CB126303)和淡水生态与生物技术国家重点实验室自主 项目(批准号: 2011FBZ12)资助 摘要 水产养殖是近30 年来世界上增长最快的农业生产方式, 但病毒已成为严重 关键词 威胁水产养殖可持续发展的传染性病原. 近 10 年来, 已从水产动物中鉴定出大量不 水产动物 病毒基因组 同的病原病毒, 解析了100 多株水产动物病毒的基因组及其遗传特征, 并开始对这些 抗病毒防御 病毒与宿主的相互作用有了系统和深入的认识. 本文在作者20 多年研究积累的基础 虹彩病毒 上, 重点评述水产动物的重要病毒如虹彩病毒、疱疹病毒、呼肠孤病毒和弹状病毒的 呼肠孤病毒 基因组遗传信息特征以及这些病毒-宿主相互作用的研究进展. 弹状病毒 疱疹病毒 病毒与宿主相互作用 近 30 年来, 水产养殖已发展成为全球农业生产 病毒、疱疹病毒和双 RNA 病毒等病毒科在内的不同 中增长最快和效率最高的产业, 被认为是中国对世 病毒, 发现虹彩病毒是引起全球鱼类、两栖类和爬行 界的重大贡献之一[1~3]. 据权威机构统计, 2013 年中 类养殖动物流行病及天然两栖类种群下降的致命性病 国水产品总产量达到 6172 万吨, 其中养殖产量 原[12~15]. 特别是近 10 年来, 随着基因组测序技术的发 4559.7 万吨, 占总产量的 73.9%; 在世界范围内, 中 展, 已有 100 多株水产动物病毒的基因组及其遗传特 国的水产养殖产量近 20 年来一直占全球水产养殖产 征被破译和解析[16~19]. 进而, 这些病毒与水产动物宿 量的 2/3 左右[4,5]. 然而, 病毒性疾病的经常发生已严 主的相互作用机制研究也有了突破性进展[19]. 本文着 重危害水产动物, 给水产养殖带来了重大经济损 重对水产动物的重要病毒如虹彩病毒、呼肠孤病毒、 失[6~8]. 近 20 年来, 全球水生动物的野生种群, 特别 弹状病毒和疱疹病毒的基因组、遗传特征以及病毒与 是蛙等两栖动物, 自然种群不断下降, 以致生态学家 宿主相互作用的最近进展作一评述. 发出了“为何蛙们都在呱呱惨叫?” 的忧叹[9~11]. 针对 这些严重问题, 世界范围内的许多病毒学家和分子 1 虹彩病毒科病毒及其基因组 生物学家都加入了这一研究行列, 已从养殖和野生 水生动物中鉴定出包括虹彩病毒、呼肠孤病毒、弹状 虹彩病毒在分类上隶属于虹彩病毒