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带阳离子侧臂的卟啉衍生物的合成及其生物活性研究-化学专业论文
摘 要
基因组区域内G-四链体结构的形成可能会对基因功能产生重要的影响,在人 类许多重要的基因组区域都已经发现富含鸟嘌呤碱基G的重复序列具有形成G- 四链体结构的可能性,而明确这些区域能否形成G-四链体及形成何种结构的G- 四链体是研究其生理功能的重要前提。因此开发一种G-四链体探针,用以将G- 四链体结构与单链及双链DNA结构明确区别开来是非常必要的。由于卟啉环与 G-四链体中G-四分体单元尺寸接近,因此卟啉及其衍生物多年来一直是G-四链 体配体研究领域的一个热点。四(N-甲基吡啶-4-基)卟啉(简写TMPyP4)是早 期发现的G-四链体配体,它与G-四链体的相互作用也已被广泛研究。但该配体对 双链DNA却几乎没有选择性。推测其原因,可能是四个甲基吡啶取代基体积偏 小,不能阻止TMPyP4与双链DNA的相互作用。本论文基于上述问题设计合成了 一种新的阳离子卟啉衍生物,并对将其用作G-四链体特异性识别探针的可行性进 行了研究。
本论文在以下几个方面做了具体的研究工作:
1、设计合成了四(1-哌啶乙氧基-苯基)卟啉(简写 TPipEOPP)和四(1- 甲基-1 哌啶乙氧基苯基)卟啉(简写 TMPipEOPP)两种卟啉化合物,并通过 IR、 核磁、质谱等手段确证了它们的结构,研究探索了其合成和分离纯化条件。
2、利用紫外光谱和荧光光谱等光学分析手段,发现TMPipEOPP在与单链、 双链DNA和G-四链体DNA相互作用时,可显示明显不同的光谱性质,能有效地 将G-四链体与单链及双链DNA区别开来,证明了TMPipEOPP是区别G-四链体与 单链及双链DNA的高效光学探针,区分结果甚至裸眼即可判定。也就是说, TMPipEOPP具有比TMPyP4更好的特异性识别G-四链体的能力。
3.通过Scatchard分析和Job plot分析探索了G-四链体与TMPipEOPP之间的结 合模式。发现在低的[G-四链体]/[TMPipEOPP]浓度比下,每个G-四链体分子可以 结合两个TMPipEOPP分子,其中一个TMPipEOPP分子堆积在G-四链体的末端G- 四分体平面上,另一个以外部结合模式作用在G-四链体的沟中。而在高的[G-四 链体 ]/[TMPipEOPP] 浓度比下,结合模式变为两个 G- 四链体分子结合一个 TMPipEOPP分子,即一个TMPipEOPP分子堆积在两个G-四链体之间。
关键词: 阳离子卟啉 G-四链体 DNA 光学探针
ABSTRACT
The in vivo formation of G-quadruplex is proposed to be important with in cells. G-rich sequences with a high potential to form G-quadruplexes are found in many important genomic regions. Accurate conformational detection of these gene sequences is a prerequisite for elucidating their biological functions. To achieve this, a probe that specifically recognizes G-quadruplexes in the presence of duplex and single-stranded DNAs must be developed. Because the size of the porphyrin core is close to the G-quartet, porphyrin derivatives are important candidates in G-quadruplex ligand studies. Previously discovered 5,10,15,20-Tetrakis(N-methylpyridinium-4-yl)- 21H,23H-porphyrin (TMPyP4) is a well-known G-quadruplex ligand, and the binding interaction between TMPyP4 and G-quadruplexes has been extensively studied. However, TMPyP4 has almost no selectivity for G-quadruplex against duplex DNA. One reason might be that the four side arm methylpyridine
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