8种贵州药用植物内生放线菌的分离及多样性研究.PDF

微生物学通报 Dec. 20, 2018, 45(12): 2673−2683 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180074 研究报告 8 种贵州药用植物内生放线菌的分离及多样性研究 闫晓睿 杨超 安明彪 石慧昌 李红颖 庹利* (遵义医学院医学与生物学研究中心 遵义市理化分析测试工程研究中心 贵州 遵义 563006) 摘 要：【背景】药用植物内生菌能产生多种活性较好的次级代谢产物，是新抗生素发现的重 要来源。目前，药用植物内生菌的研究主要集中在内生真菌，内生放线菌研究相对较少，是一 个尚未充分开发的新领域。【目的】研究贵州药用植物内生放线菌多样性，以期发现新种放线 菌或产新活性物质的放线菌，为微生物药物研究奠定基础。【方法】药用植物样品表面消毒后 用粉碎机粉碎，采用 9 种不同分离培养基分离放线菌；通过提取放线菌基因组 DNA ，PCR 扩 增 16S rRNA 基因序列，测定序列并提交 EzBioCloud 数据库进行序列比对，构建系统进化树， 进行内生放线菌多样性分析。【结果】通过形态特征初步排重，从8 种药用植物样品中共分离 得到内生菌 62 株，测定其 16S rRNA 基因序列，序列比对结果表明其中的 57 株菌分布于放线 菌域的 5 目8 科 16 属，分别是短小杆菌属(Curtobacterium) 、链霉菌属(Streptomyces) 、微杆菌 属(Microbacterium) 、纤维单胞菌属(Cellulomonas) 、植物杆菌属(Plantibacter) 、原小单孢菌属 (Promicromonospora) 、动球菌属(Kineococcus) 、壤球菌属(Agrococcus) 、沼杆菌属(Patulibacter) 、 气微菌属(Aeromicrobium) 、拉贝达氏菌属(Labedella) 、叶居菌属(Frondihabitans) 、冷杆菌属 (Frigoribacterium) 、节杆菌属(Arthrobacter) 、动孢菌属(Kineosporia) 、Amnibacterium 属，其中 短小杆菌属(Curtobacterium)为优势菌属，菌株 M8JJ-5 和 M2KJ-4 的 16S rRNA 基因序列分别与 有 效 发 表 菌 株 Amnibacterium kyonggiense KSL51201-037T (FJ527819) 和 Aeromicrobium fastidiosum DSM10552T (Z78209) 的相似性最高，相似性分别为 97.29%和 98.95% ，可能为潜在 新物种。【结论】贵州药用植物中蕴藏着多样性丰富的放线菌且具有从中发现新放线菌的潜力， 能为新抗生素的发现提供菌种储备，也为今后对该地区放线菌资源的认识和开发利用提供理论 依据。 关键词：药用植物，内生放线菌，多样性 Foundation items: National Natural Science Foundation of China ; Youth Science and Technology Personnal Growth Project of Guizhou Provincial Education Department (QianJiaoHe KY Zi[2016]200); Startup Foundation for Docotors of Zunyi Medicinal University (F-749); Undergraduate Training Progra