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- 2018-12-08 发布于安徽
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总体安排:
第一章:有机化学基础——生物化学中的一些重要概念
第二章:静态生化
第三章:动态生化
第一节:糖类、脂类代谢及其调控
第二节:蛋白质代谢及其调控
第三节:核酸代谢及其调控
第一章 有机化学基础——生物化学中的一些重要概念
一、如何用投影式观察一个分子的立体结构:通常都将碳链放在垂直线上,以垂直线相连的基团表示伸向纸后(即远离我们);以水平线相连的基团表示伸出纸前(即伸向我们)。
二、有机化合物的分类:数以百万计的有机物,可以按照它们的结构分成许多类。一般的分类方法有两类:一是根据分子中碳原子的连接方式(碳的骨架)分类;二是根据决定分子主要化学性质的特殊原子或基团(官能团)分类。这两种方法经常是混合使用的。
1、根据碳的骨架可以把有机物分成三类:
(1)开链化合物(脂肪族化合物):这类化合物中的碳架成直链(即不带有支链),或为带有支链的开链,由于长链状的化合物最初是在油脂中发现的,所以开链化合也叫脂肪族化合物。
(2)碳环化合物:这类化合物分子中含有完全由碳原子组成的环,又可分为:
①脂环族化合物:性质与脂肪族化合物相似,在结构上也可看作是由开链化合物关环而成。
②芳香族化合物:分子中都有一个或多个苯环,它们在性质上与脂肪族化合物有较大的区别。
(3)杂环化合物:这类化合物分子中的环是由碳原子与其它元素的原子共同组成的。
这里只是让大家有一个感性认识,以后涉及到这些化合物时不致太生疏。
①五元杂环:
举例:吡咯、叶绿素、血红素及维生素B12
吡咯的许多衍生物广泛分布于自然界,如叶绿素、血红素、它们都是有重要生理作用的细胞色素,叫做卟啉类化合物。
叶绿素和血红素具有相同的基本骨架——卟吩。卟吩是由四个吡咯环的α-碳原子通过次甲基(—CH=)相连而成的复杂体系,所以叶绿素、血红素等都有颜色。
②六元杂环:
举例1:嘧啶、核苷、核苷酸与核酸 :烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
核苷可以看作是糖分子中的半缩醛羟基(-OH)与杂环中氮原子上的氢(-H)去水形成。
举例2:吡啶、维生素PP与辅酶Ⅰ(CoⅠ、NAD+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)、辅酶Ⅱ(CoⅡ、NADP+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)
维生素PP是B族维生素之一,它参与机体的氧化-还原过程,能促进组织新陈代谢,降低血中的胆固醇,体内缺乏维生素PP时能引起糙皮病,所以维生素PP也叫抗糙皮病维生素。
维生素PP包括β-吡啶甲酸(烟酸、尼克酸)及β-吡啶甲酰胺(烟酰胺、尼克酰胺)两种物质。
β-吡啶甲酰胺是NAD+、NADP+中的一个重要组成,是生物体内氧化还原过程中传递氢和电子的辅酶之一,为极重要的化合物。
③稠杂环
举例1:吲哚与吲哚乙酸:一般认为吲哚乙酸是由色氨酸衍生而来。
举例2:花色素——苯并吡喃的衍生物。
花色素是一类重要的植物色素,花色素与糖结合成花色苷,存在于花和果实中。
花青(素)是花色苷的一种,它的颜色与介质的PH值密切相关:pH值介于7-8时,它呈淡紫色;pH3时,呈红色;pH11时呈蓝色,其颜色的改变是由于其结构在不同介质中发生变化所致。同一种花青素在不同的PH值下能显示不同颜色,不仅如此,其颜色也能随环境中金属离子的存在而改变,所以同一种花青素在不同的花中,或是同一种花由于种植的土壤不同,都能显出不同的颜色。
举例3 :嘌呤、核苷、核苷酸与核酸
举例4:蝶呤与叶酸、维生素B2 (核黄素)
叶酸参与嘌呤与嘧啶环的生物合成,体内缺乏叶酸则患恶性贫血症;
维生素B2是FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)、FMN(黄素单核苷酸)的组成成分,是生物体内氧化还原过程中传递氢和电子的辅酶之一,极重要。
举例5:生物碱
生物碱是指一类存在于生物体中的有机碱性物质,由于它们主要存在于植物中,所以也常叫植物碱,已发现数千种,氨基酸是生物碱合成的前身。
2、根据官能团分类:将含有同样官能团的化合物归为一类,因为一般来说,含有同样官能团的化合物在化学性质上是基本相同的。
有些较复杂的化合物经常含有多个官能团,如单糖分子、氨基酸分子、核苷酸分子等。
三、化合物的构型与构象
1、手性碳原子与手性分子
手性:实物与镜像不能重叠的特点叫做“手性”,某些化合物也有这种手性特征。
手性碳原子(不对称碳原子):是连接四个不同原子或基团的碳原子(以*号表示)。
手性分子:一般指有手性碳原子的分子。
2、有机物的旋光活性。
偏振光:仅在某一平面上振动的光,叫平面偏振光。
旋光活性物质:有些有机物可将偏振光的振动平面旋转一定的角度,具有这种性质的物质,叫旋光活性物质。
3、构型:指一个分子由于其中各原子特有的、固定的空间排列,使该分子具有的特定的立体化学结构。当某一物质由一种构型转变为另一种构型时,要求共价键的断裂和重新形成。
4、构象:指一个分子中,不改
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