甘蓝型油菜防御素基因的克隆与生物信息学分析.PDFVIP

中国农学通报 2015,31(8): 108-112 Chinese Agricultural Science Bulletin 甘蓝型油菜防御素基因的克隆与生物信息学分析 高天姝，郑小敏，郭 楠，白瑞英，黄兴琳，陆俊杏，龚慧明，张 涛 （重庆师范大学生命科学学院/重庆市植物环境适应分子生物学重点实验室，重庆401331 ） 摘 要：为了研究甘蓝型油菜防御素基因的结构和功能，根据白菜防御素基因序列设计引物，采用RT- PCR 方法从甘蓝型油菜中克隆到4 个防御素基因，并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明，甘蓝 型油菜防御素基因cDNA 全长325~335 bp ，包含231~243 bp 的开放阅读框，编码76~80 个氨基酸；防御 素基因在长期进化过程中产生了显著的差异，但防御素含有的8 个保守半胱氨酸残基均稳定存在； Bndef1、Bndef2、Bndef3与萝卜Rs-AFP1、诸葛菜Omdef亲缘关系较近，Bndef4与豇豆Vudef亲缘关系较 近；4 个防御素蛋白均为稳定蛋白，具有信号肽结构，可能为分泌蛋白。 关键词：甘蓝型油菜；植物防御素；克隆；生物信息学分析