松江鲈鱼野生群体遗传多样性RAPD分析和SCAR标记.PDFVIP

动 物 学 研 究 2012，Apr. 33(2): 203−210 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI ：10.3724/SP.J.1141.2012.02203 松江鲈鱼野生群体遗传多样性的 RAPD 分析和 SCAR 标记的转化 * * # # 曾 珍, 刘至治 , 潘连德 , 唐文乔, 王 茜 , 耿云皓 （上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306 ） 摘要：首先, 从 294 条 10 个碱基随机引物中, 筛选出 32 条多态性引物, 对富春江、黄河、滦河和鸭绿江等 4 个松江鲈鱼 (Trachidermus fasciatus)野生群体共 120 尾个体进行 RAPD 分析。结果表明, 松江鲈鱼野生群体的遗 传多样性较丰富，其主要表现在：① 在扩增得到的 591 个位点中, 有 515 个(87.14%)位点呈现多态性，群体间多 态位点比率(P) 的大小顺序为：富春江群体 89.17%黄河群体 87.99%鸭绿江群体 86.63%滦河群体 83.25%。② 松 江鲈鱼群体间的 Shannon 信息指数(I )和 Nei’s 遗传多样性指数(H )分别在 0.3393~0.3566 和 0.2157~0.2279 间, 滦 T T 河群体的值较其他 3 群体稍低；若作为一个整体, 则总的 Shannon 信息指数(I )和 Nei’s 遗传多样性指数(H )分别 T T 为 0.3710±0.2153 和 0.2336±0.1643 。③ 虽然群体间基因流值(Nm)在 5.76103～19.84497 间, 显示各地理群体间存 在程度不同的基因交流, 但分子方差分析(AMOVA)结果却表明, 各群体间存在显著(P0.05)或极显著(P0.01) 的 遗传分化。④ 聚类分析表明, 鸭绿江群体首先与黄河群体聚为一支, 再与富春江群体相聚, 最后与单独一支的滦 河群体聚类, 表明鸭绿江、黄河、富春江等 3 群体间的遗传距离与彼此间的地理距离远近密切相关, 而滦河群体 与它们的遗传距离较远。其次, 从获得的 S1225525 bp 、S1225605 bp 、S1225841 bp 、S1345695 bp 、S1345825 bp 等 5 个特异 RAPD 条带中, 成功地由 S1225605 bp 、S1225841 bp 条带分别转化出 SCAR01560 bp 、SCAR02443 bp 的 SCAR 标记。这两个标记的 出现频率, 在鸭绿江群体最高(96.67%和 93.33%)、富春江群体其次(83.33%和 90%)、黄河群体再其次（56.67%和 66.67%)、滦河群体最低(13.33%和 20%) 。因此, SCAR01560 bp 、SCAR02443 bp 可作为鉴别松江鲈鱼滦河群体与其他 3 群体的分子标记。 关键词：