南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒遗传特性分析-FluChina.PDFVIP

网络出版时间：2017-10-20 13:23:37 网络出版地址：/kcms/detail/21.1234.R1323.016.html １ «中国公共卫生»最新录用 １１１６２９９ 南宁市１株人感染高致病Ｈ７Ｎ９禽流感病毒遗传特性分析∗ 裴建新ꎬ秦剑秋ꎬ农皓ꎬ詹鑫婕ꎬ杨丞ꎬ何冰ꎬ刘海燕 　 　 摘　 要:目的　 通过对广西省南宁市２０１７年首例人感染高致病Ｈ７Ｎ９ 禽流感病毒株血凝素ＨＡ及神经氨酸酶 ＮＡ基因测序ꎬ从分子水平分析毒株的溯源及遗传特性ꎮ 方法　 通过ＲＴ－ＰＣＲ扩增Ｈ７Ｎ９禽流感毒株ＨＡ基因和 ＮＡ基因并测序ꎬ经ＮＣＢＩ数据库ＢＬＡＳＴ 比对ꎬ利用ＭＥＧＥ５１等软件构建进化树及统计蛋白关键位点的变异情 况ꎮ 结果　 系统进化树表明中国Ｈ７Ｎ９毒株ＨＡ基因与ＮＡ基因主要为２个类群ꎬ长三角分支和珠三角地区分支ꎬ 南宁毒株Ａ/ Ｎａｎｎｉｎｇ/ ０１/ ２０１７(Ｈ７Ｎ９)ＨＡ和ＮＡ基因均在珠三角分支上ꎬ与广东毒株高度同源ꎮ 病毒ＨＡ蛋白裂 解位点插入４个氨基酸由ＰＥＩＰＫＧＲ↓ＧＬＦ突变为ＰＥＶＰＫＲＫＲＴＡＲ↓ＧＬＦꎬ含有５个碱性氨基酸ꎬ使其具有高致病 性禽流感病毒的分子特征ꎻ毒力相关位点２２５ 由天冬氨酸(Ｄ)突变为甘氨酸(Ｇ)(Ｄ２２５Ｇ)ꎬ毒力增强ꎻ受体结合 １８６位点由甘氨酸(Ｇ)突变为缬氨酸(Ｖ)(Ｇ１８６Ｖ)ꎻ飞沫传播关键氨基酸位点没有发生突变组合ꎻ糖基化位点高度 保守ꎮ ＮＡ蛋白丢失５个氨基酸ꎬ毒力可能增强ꎬ耐药性位点、糖基化位点均相对保守ꎬ未发生突变ꎮ结论　 南宁市 人感染Ｈ７Ｎ９禽流感病毒可能来源于广东省珠三角地区禽类的感染ꎬ人传人的可能性不大ꎬ对神经氨酸酶抑制剂 药类敏感ꎬ但毒株已经具有高致病性禽流感病毒的分子特征ꎬ毒力增强ꎮ 南宁市外环境已经检测到Ｈ７Ｎ９ 核酸阳 性标本ꎬ提示需要加强监测有效防控传染源ꎮ 　 　 关键词:Ｈ７Ｎ９禽流感ꎻ血凝素ꎻ神经氨酸酶ꎻ高致病性ꎻ遗传变异 中图分类号:Ｒ５１１７ 文献标志码:Ａ 文章编号:１００１￣０５８０(２０１６)０７￣１０００￣０３ ＤＯＩ:１０.１１８４７/ ｚｇｇｇｗｓ２０１６￣３２￣０７￣００ Ｇｅｎｅｔｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆａｈｉｇｈｌｙｐａｔｈｏｇｅｎｉｃａｖｉａｎｉｎｆｌｕｅｎｚａＡ(Ｈ７Ｎ９) ｖｉｒｕｓ ｓｔｒａｉｎ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｉｎ Ｎａｎｎｉｎｇ ｃｉｔｙ ＰＥＩ Ｊｉａｎ￣ｘｉｎꎬＱＩＮ Ｊｉａｎ￣ｑｉｕꎬＮＯＮＧ Ｈａｏꎬｅｔ ａｌ(Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ＬａｂｏｒａｔｏｒｙꎬＮａｎｎｉｎｇ Ｍｕｎｉｃｉｐａｌ Ｃｅｎｔｅｒｆｏｒ Ｄｉｓｅａｓｅ Ｃｏｎ￣ ｔｒｏｌ ａｎｄ ＰｒｅｖｅｎｔｉｏｎꎬＮａｎｎｉｎｇꎬＧｕａｎｇｘｉＺｈｕａｎｇＡｕｔｏｎｏｍｏｕｓＲｅｇｉｏｎ５３００２３ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　 Ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｔｒａｃｅａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆａｈｉｇｈｌｙｐａｔｈｏｇｅｎｉｃＨ７Ｎ９ ａｖｉａｎ ｉｎ￣ ｆｌｕｅｎｚａ ｖｉｒｕｓ ｓｔｒａｉｎ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｉｎ Ｎａｎｎｉｎｇ ｃｉｔｙꎬ２０１７ ｔｈｒｏｕｇｈ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｏｆ ｈｅｍａｇｇｌｕｔｉｎｉｎ(ＨＡ)ａｎｄ ｎｅｕｒａｍｉｎｉｄａｓｅ(ＮＡ) ｇｅｎｅ ｏｆ ｔｈｅ ｖｉｒｕｓ.Ｍｅｔｈｏｄｓ　 Ｂｏｔｈ ＨＡ ａｎｄ ＮＡ ｇｅｎｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｖｉｒｕｓ ｗｅｒｅ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｗｉｔｈ ｒｅａｌ－ｔｉｍｅ ｒｅ￣ ｖｅｒｓｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ＰＣＲ(ＲＴ －ＰＣＲ)ａｎｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ ｗｉｔｈ Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌ(ＢＬＡＳＴ)ｄａｔａｂａｓｅ ｏｆ Ｎａ￣ ｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ(ＮＣＢＩ).Ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｃ ｔｒｅｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｗａ