一株新笑的hiv-1crf01_aecrf07_bc独特重组型毒株的鉴定.docxVIP

中文摘要中文摘要 中文摘要 中文摘要 HIV-1最重要的特征之一是其具有高度的遗传多样性，基因重组在其中扮演 了十分重要的角色。全球范围内HIV-1流行重组型和独特重组型越来越多，并 在HIV的流行中发挥着越来越重要的作用。 本研究选择了一份来自于吉林省同性恋HIV感染者的血浆样本，采用近末 端稀释的方法对该样本进行近全长基因组(Near full．1ength genome，NFLG)扩 增，电泳鉴定结果表明成功扩增出9．1kb的近全长基因组片段。获得的阳性PCR 产物经胶纯化后直接进行序列测定，获得的序列数据经拼接和清理后，采用 MEGA 5．05软件进行系统进化树分析，SimPlot 3．5．1软件进行重组断点分析， BioEdit 7．0．9．0软件进行序列比对分析。 重组断点分析结果显示，该序列由CRF01 AE和CRF07 BC重组形成，主 要骨架为CRF01 AE，序列中包括4个重组断点，相对于HXB2分别位于443 lbp， 4739bp，5501bp和5825bp，2个CRF07 BC片段存在于pol基因和vif-vpr基因 区段，长度分别为340bp和323bp。 系统进化树分析结果显示，该病毒中的3个CRF01 AE片段均与来源于我 国北方主要在MSM人群中流行的CRF01 AE毒株聚集在一起，其Bootstrap值 为100％，这一结果提示CRF01 AE