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- 2018-12-22 发布于福建
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生物化学笑第十三章蛋白质
概述 §1 遗传密码 §2 核糖体 §3 转移RNA的功能 §4 蛋白质生物合成的分子机制 §5 真核生物与原核生物 蛋白质合成的差异 概 述 mRNA→Pr就好象以一种语言翻译成另一 种语言时的情形相似,所以称以mRNA为模板的蛋白质合成过程为翻译(translation)。 参与蛋白质生物合成的物质 原料-氨基酸 mRNA-模板 tRNA-运输氨基酸工具 合成场所-核糖体 酶及多种蛋白质因子 ATP、GTP mRNA中的相邻的三个核苷酸组成的三联体代 氨基酸就像电报中的阿拉伯字母代表文字一样, 所以称三联体为遗传密码。 三联体密码子是mRNA上三个连续的核苷酸 遗传密码的破译:前后差不多经历了近7年的时间(1961年-1966年),Ochoa、Khorana 和Nirenberg是最主要的功臣。 遗传密码字典 1.无标点符号,且相邻密码子互不重叠。 2.简并性:指一种氨基酸对应着两个或更多个密码子。(有61个为20种标准氨基酸编码)。 在64组密码子中,有61个为氨基酸密码子。但是标准氨基酸有20种)。 AUG是起始密码;UAG、UAA、UGA是终止密码子,它们不代表任何氨基酸。 氨基酸密码子的兼并性 3.变偶性(摇摆性) tRNA反密码子与密码子配对第一位、二位碱基严格,第三位碱基可变的现象——变偶性。 同义密码子:对应于同一种氨基酸的不同密码子。 大多数同义密码子差别在第三位核苷酸。 密码子可用XY UC 或 XYAG 表示。即第三个核苷酸的专一性较差。 通用性:原核和真核生物共使用同一套遗传密码。 这也是转基因的基础。 但自80年代研究发现 密码的防错系统 密码表是一个故障-安全系统: 密码的编排具有防错功能,密码子中碱基顺序与其相应的氨基酸物理化学性质有着巧妙关系。密码子中第二位碱基决定其氨基酸极性。 中间碱基是U,编码的氨基酸是非极性、疏水的和支链的,常在球蛋白的内部。 中间碱基是C,编码的氨基酸是非极性或不带电荷的极性侧链。 中间碱基是A或G,相应氨基酸具有亲水性,在球蛋白的外周。 第一位碱基是A或C,第二位碱基是A或G,第三位碱基可以是任意的,相应氨基酸具有亲水侧链并有碱性。 前两位是AG,第三位碱基是任意的,相应氨基酸为酸性氨基酸。 核糖体是蛋白质合成的部位 核糖体的组成和结构 核糖体的功能蛋白质合成的工厂催化蛋白质合成 概述 多聚核糖体 §3 转移RNA的功能 tRNA转运活化的氨基酸至mRNA模板上 包括:肽链合成的起始、延长、终止和释放等 (大肠杆菌)。 1.肽链合成的起始——起始复合体的形成 需要30S核糖体亚基、 50S亚基、 mRNA、 甲硫氨酰-tRNA、起始因子IF1 IF2 IF3、 GTP 的参与。 参与大肠杆菌的起始因子有三个: IF-1和IF-2:促进tRNAfMet,mRNA,30S小亚基结合。 IF-3:使已完成合成的核糖体大小亚基解聚。 真核生物的起始因子更多,至少有九个: eIF-1,eIF-2,…. —肽键的形成,增加氨基酸 在延长因子EFTu和EFTs和GTP的作用下: (1)进位(Entry) (2)转肽(transpeptidation) (脱落) (3)移位(translocation) 循环一次,延长一个氨基酸。 在氨基酸的掺入过程中有3个重复的延伸反应: 当起始复合物形成以后,肽链的合成即进入延伸阶段,延伸阶段所发生的主要事件是进位、转肽和移位且不断的循环。 过程: 3.终止与释放 当A位进入终止密码(UAA,UGA,UAG)时,即宣告翻译终止。原核生物中有三种释放因子(release factors RF); 在RF-3的辅助下,释放因子RF-1(识别UAA或UAG密码子)或RF-2(识别UGA密码子)与核糖体结合, 这
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