蛋白预测-转录后儿修饰及其相互作用.pptVIP

转录后修饰预测 Post-translational modification prediction 蛋白质合成后的分泌及加工修饰 不论是原核还是真核生物，在细胞浆内合成的蛋白质需定位于细胞特定的区域，有些蛋白质合成后要分泌到细胞外，这些蛋白质叫做分泌蛋白。在细菌细胞内起作用的蛋白质一般靠扩散作用而分布到它们的目的地。如内膜含有参与能量代谢和营养物质转运的蛋白质；外膜含有促进离子和营养物质进入细胞的蛋白质；在内膜与外膜之间的间隙称为周质，其中含有各种水解酶以及营养物质结合蛋白。 真核生物细胞结构更为复杂，而且有多种不同的细胞器，它们又具有各不相同的膜结构，因此合成好的蛋白质还要面临跨越不同的膜而到达细胞器械，有些蛋白质在翻译完成后还要经过多种共价修饰，这个过程叫做翻译后处理。 运输标签---信号肽 信号肽预测结果 有的非分泌性蛋白，虽然C分和S分都高于域值， SignalP根据其Y分和S分平均值仍能作出准确判断 对于典型的非分泌蛋白，整个序列的各项分数都很低， 练习 烯醇化酶x56832是在线粒体膜上，用信号肽软件分析一下该基因编码蛋白信号肽，分析一下结果。 Cd133（ p00533）是细胞膜表面蛋白，用信号肽软件分析该蛋白信号肽序列。 在ncbi上检索x56832 找出编码蛋白 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSG