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- 2018-12-30 发布于安徽
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应用红外光谱研究生物大分子的结构
谢孟峡 刘媛
北京师范大学分析测试中心,北京 100875, HYPERLINK mailto:xiemx@bnu.edu.cn xiemx@bnu.edu.cn
一、蛋白质二级结构的测定
蛋白质的空间结构主要有四级,其结构层次示意图见图1。稳定蛋白质三维结构的主要作用力有五种,分别是盐键、氢键、疏水作用、范德华力和二硫键。这些都是共价键相互作用,其中对于二级结构,最重要的作用力是蛋白质分子中的氢键。
图1 蛋白质结构层次示意图
其中:Q为四级结构,T/α为由结构域组成的三级结构或亚基,D/T为结构域或三级结构,
sS为超二级结构,S为二级结构,A为组成一级结构的氨基酸
在所有已测定的蛋白质中,都有广泛的二级结构存在。蛋白质的二级结构形式主要包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲四种。这些二级结构中将螺旋看成蛋白质复杂构像的基础,β-折叠是蛋白质中又一种普遍存在的规则构像单元。无论是α-螺旋还是β-折叠都存在着许多氢键,致使规则的二级结构都具有相当的刚性,如果一段肽链中没有氢键或其他相互作用,那么各个残基之间就有更大的自由度,转角就是典型的介于此两种情况之间的一种二级结构,是一种部分规则的构像(见图2)。此外还有一些肽段相对于前面的三种二级结构是无规则,它们有更大的任意性,可是这些肽段的构像又不是完全任意的,因为每种
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