上海港到港船舶压载水沉积物细菌群落多样性-上海海洋大学学报.PDF

文章编号：１６７４５５６６（２０１８）０３０３４４０６ ＤＯＩ：１０．１２０２４／ｊｓｏｕ．２０１７１２１０００７ 上海港到港船舶压载水沉积物细菌群落多样性 １，２ １，２ ３ １，２ １，２ 王　琼 ，王飞飞 ，边佳胤 ，肖南燕 ，吴惠仙 （１．上海海洋大学 海洋生态与环境学院，上海　２０１３０６；２．上海海洋大学 港航生态安全研究中心，上海　２０１３０６；３．国 家海洋局东海分局 舟山海洋工作站，浙江 舟山　３１６０００） 摘　要：为了解船舶压载水沉积物中微生物多样性，利用ＩｌｌｕｍｉｎａＭｉＳｅｑ２５００高通量测序平台对上海港到港 船舶压载水沉积物中细菌基因样本进行测序，并进行生物信息分析。从 １１份压载水沉积物样品中共检测到 ４２００６９条有效序列，微生物群落分析结果显示共有３８门、９８纲、２２６目、３９３科、７０４属细菌，优势类群为变形 菌门（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ７２．９８％）、放线菌门（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ９．１１％）、拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ８．７１％）、绿弯菌门 （Ｃｈｌｏｒｏｆｌｅｘｉ４．０６％）、芽单胞菌门（Ｇｅｍｍａｔｉｍｏｎａｄｅｔｅｓ１．４７％）、酸杆菌门（Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ１．１８％）和其他 （２．５０％）。本次研究在压载水沉积物中检测到了分枝杆菌属（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、游动球菌属（Ｐｌａｎｏｃｏｃｃｕｓ）、假 单胞菌属（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）、类芽孢杆菌属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）和链霉菌属（Ｉｎｑｕｉｌｉｎｕｓ）的致病菌或条件致病菌。结果 显示压载水沉积物中微生物多样性丰富，要充分重视我国到港船舶压载水沉积物中微生物以及致病菌的研 究，为阐明外来致病菌通过压载水途径入侵的机制和防控奠定基础。 关键词：上海港；压载水沉积物；细菌；多样性 中图分类号：Ｑ９３９．１；Ｓ９１７　　　文献标志码：Ａ 　　外来水生生物的成功入侵对近海的生态系 体底部，最能真实反映舱内微生物群落的完整 ［１２］ 性，国内仅在大连和江阴开展了压载水沉积物细 统造成灾难性破坏 ，已严重威胁我国海洋生 态系统的安全。压载水是船舶维持平衡与安全 菌相关的研究［１２，１４］。上海港是上海国际航运中 ［３］ 心的重要组成部分，承担着上海进出物资总量 航行的重要保障 。船舶压载水的压载和卸载 ［１５］ 过程是造成地理性隔离水体间海洋生物传播的 ６０％的运输任务 ，是全球第一大集装箱港，压 ［４５］ 载水的排放量大，外来生物入侵潜在风险高。研 主要途径 。每天有超过７０００种生物通过压 载水在全球传播［６］，其 中细菌的数量高达 究上海港到港远洋船舶沉积物中细菌多样性，分 １９［３］ 析细菌群落特征，可为阐明压载水沉积物中微生 １０ 。 早期有关压载水微生物的研究主要关注压 物多样性，探讨微生物在船舶压载水生态系统中 载水中大肠埃希氏菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉ）、肠道球菌 的作用，以及为港口外来生物的入侵防控提供理 论基础。 （Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）和霍乱弧菌（Ｖｉｂｒｉｏｃｈｏｌｅｒａｅ）三种 ［７１２］ 致病菌 。因此压载水中细菌群落多样性未有 １　材料与方法 深入研究。２００７年始出现有关压载水中细菌的 ［３］ ［１３］ １．１　样品采集 总体数量的系统研究报道 ，ＢＲＩＮＫＭＥＹＥＲ ［１４］ 在２０１５年夏季，抽取 １１艘抵达上海港后进 和ＬＶ 发现压载水中存在较多的导致人、鱼