副干酪乳杆菌prcA基因克隆及生物信息学分析.PDFVIP

中国农学通报 2014,30(18):259-263 Chinese Agricultural Science Bulletin 副干酪乳杆菌prcA基因克隆及生物信息学分析 王 洋，葛菁萍，由 田，平文祥 （微生物黑龙江省高校重点实验室，黑龙江大学生命科学学院，哈尔滨150080） 摘 要：旨在了解副干酪乳杆菌prcA基因的结构和功能，探明prcA基因与副干酪乳杆菌拟群体效应相关 基因—自诱导肽编码基因之间的联系。通过PCR 方法对副干酪乳杆菌中prcA进行扩增，并通过生物信 息学方法对该基因的核苷酸组成、蛋白质构象等方面进行预测和分析。克隆得到的prcA基因全长为 416 bp ，包括一个138 bp 的开放阅读框，编码45 个氨基酸，蛋白分子量为5326.83 Da ，等电点为4.85，是 一种稳定蛋白，不含跨膜区，蛋白质的二级结构以α-螺旋、不规则卷曲和延伸主链组成，亚细胞定位预测 显示该蛋白主要位于细胞外；prcA基因为副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因，负责 细菌素生成的调控。 关键词：副干酪乳杆菌