暑期班-分子生物学机制.pptVIP

肿瘤分子生物学机制研究策略 郭 鹏 西安交通大学泌尿外科研究所 郭鹏，西安交通大学医学院泌尿外科研究所教授，博士生导师。 2003年从复旦大学上海医学院获生物化学与分子生物学博士学位。 2004-2009年，美国埃默里(Emory)大学医学院Winship癌症研究所博士后； 2009-2010年任埃默里(Emory)大学医学院讲师(Instructor)。 2010年6月回国担任西安交通大学教授，获得西安交通大学光华青年学者基金资助。 在JBC，Int. J. Cancer, Oncogene, Cancer Res. 等英文期刊上发表SCI文章40余篇。曾获美国国防部前列腺癌研究计划博士后培训基金资助，目前主持2项国家自然科学基金面上项目。 美国癌症研究学会(AACR)会员，美国基础泌尿外科研究学会(SBUR)会员。《现代泌尿外科杂志》编委，《Advances in Oncology Research》编委。 研究生科研能力培养 高水平医学论文必备要点 分子机制研究的几点经验 创新能力 批判性思维 专业素养 短板：表达能力 研究生科研能力培养 创 新 能 力 发现新现象、新事物、新方法； 发现已知事物的新作用； 建立已知事物之间的新关系； 提出新概念、新假说； 创新是高层次的综合能力，是科研能力的核心，创新性也是论文、课题评审的最重要评价标准。 批判性思维（Critical thinking） 能动、持续和细致地思考任何信念或被假定的知识形式，洞悉支持它的理由以及它所进一步指向的结论（杜威)。 以理性方式推断现有理论或已知结论的正确与不足之处。 培养方式： Journal Club 讲座提问、讨论 日常读文献 对本领域前沿的了解； 重要实验技术； 文献获取、阅读与管理、引用； 课题构思、标书撰写； 科研论文撰写； 表达能力与交流能力培养。 表达能力：缺少锻炼机会 专业素养 How does the editor evaluate a paper? Does it ask an interesting or important question? Does it provide significant conceptual advances? Does it provide novel mechanistic insights? Does it provide new findings of physiological relevance? Significance Technical quality Logic 高水平医学论文必备的几大要素 高通量技术筛选 芯片 二代测序 数据库预测 TCGA Oncomine GEO 根据文献、前期结果预测 确定目标分子 确定目标分子在肿瘤组织与正常对照组织中差异及潜在机制 确定目标分子在肿瘤组织中的功能 确定目标分子实现其功能的分子机制 目标分子与疾病进展、诊断、预后的关系 肿瘤基础研究课题的框架 确定目标分子在肿瘤组织中的功能 Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell 144(5), 646–674 确定目标分子在肿瘤组织中的功能 增加/减少目标分子 质粒/shRNA质粒 siRNA 病毒/病毒-shRNA Cas9/CRISP 激活/抑制目标分子 检测相应细胞生物学行为 各信号通路 Marker Tips: 敲除时用至少两个序列。各实验应使用至少两个细胞系。 突变 表达差异 翻译后修饰差异 定位差异 确定目标分子在肿瘤组织与正常对照组织中差异 遗传学方法 质谱 影像学方法 转录 转录因子 增强子 启动子 DNA甲基化 表观遗传学修饰 mRNA水平变化 转录后调控 RNA splicing mRNA 稳定 转录因子 增强子 表观遗传学修饰 RNA splicing 蛋白水平变化 翻译水平调控 翻译后修饰 肽链稳定性、折叠 泛素化、蛋白降解 miRNA mTOR通路 热休克蛋白 糖链修饰 确定目标分子实现其功能的分子机制 目标分子如何调控下游关键通路？ 公认能直接影响细胞生物学行为、疾病进展的分子、通路 调控方式： 表达量变化 相互作用改变其修饰、定位、功能 The effect of AR signaling on the proliferation, migration, and invasion of RCC 769-P, 786-O, and SW839 cell lines. ?2014 by American Association for Cancer Research 769P AR/VEC (fold) SW839 SiAR/SC (fold) KAI-1 13.34