《绵羊MHCClassII基因的生物信息学分析》-毕业论文设计（学术）.docVIP

PAGE 湖 南 科 技 大 学 毕 业 设 计（ 论 文 ） 题目 绵羊MHC ClassⅡ基因的生物信息学分析 作者 学院 生命科学学院 专业 生物科学 学号 指导教师 年 月 日 湖 南 科 技 大 学 毕业设计（论文）任务书 生命科学学院 院 生物工程 系（教研室） 系（教研室）主任: （签名） 2011 年 1 月 18 日 学生姓名: 学号: 07090101025 专业: 生物科学 1 设计（论文）题目及专题： 绵羊 MHC Class = 2 \* ROMAN II基因的生物信息学分析 2 学生设计（论文）时间：自2011年 1月18日开始至 2011 年 6 月 10 日止 3 设计（论文）所用资源和参考资料： 3.1所用资源:万维网上的生物数据库;学校所购买的电子期刊;校图书馆;学院实验室网络； 3.2 参考资料:张阳德编著.生物信息学[M]北京:?科学出版社,2004.9.金伯泉.细胞和分子免疫学[M].科学出版社，2006,281-305. 许忠能.生物信息学[M]. 清华大学出版社，2008,1-4. 杨晶，胡刚，王奎，沈世镒.生物计算——生物序列的分析方法与应用[M].科学出版社，2010，105-111. 4 设计（论文）应完成的主要内容： 4.1获取绵羊 MHC Class = 2 \* ROMAN II基因核酸与蛋白序列及与其同源的其它物种的序列，进行多序列比对，做出分子进化树，并分析； 4.2对绵羊 MHC Class = 2 \* ROMAN II分子的疏水区、跨膜区、功能结构域和生物活性位点分析； 4.3预测绵羊 MHC Class = 2 \* ROMAN II分子的二级结构与三级结构。 5 提交设计（论文）形式（设计说明与图纸或论文等）及要求： 5.1严格按照湖南科技大学本科生毕业设计（论文）工作规范的写作完成毕业论文，完成不少于8000字信息量的论文；格式正确，包括目录、论文中英文题目及摘要、前言、正文、参考文献、致谢词和附录； 5.2 在实验及论文写作过程中，对数据和结果等要求实事求是，并且要在老师的指导下独立完成。 6 发题时间： 2011 年 1 月 17 日 指导教师： （签名） 学 生： （签名） 摘 要 从NCBI中获取绵羊主要组织相容性复合体（Major Histocompatibility Complex，MHC）Ⅱ的核苷酸与氨基酸序列，应用生物信息学原理,对绵羊MHCⅡ分子疏水区、跨膜区、结构功能域和生物活性位点等几方面生物学特性进行了分析，预测出该基因的二级结构和三级结构，并将绵羊与其它动物的核苷酸和氨基酸序列进行多序列对比，做出分子进化树。结果表明，绵羊MHCⅡ分子有一个疏水区和跨膜区；该分子有主要组织相容性复合物蛋白免疫球蛋白信号及N-糖基化位点、蛋白质激酶C磷酸化位点等多个生物活性位点。绵羊MHC classⅡ的氨基酸序列和核苷酸序列与成都麻羊的同源性最高，分别达66%和73%，其次与亚洲水牛和肩蜂牛的同源性也较高，与大黄鱼的同源性最低，分别为25%和51%。 关键词：主要组织相容性复合体Ⅱ类；生物信息学；序列分析 ABSTRACT Extract Ovis aries from NCBI of nucleot