生物化学酶催化机制
(2)三维结构的研究 酶的三维结构决定了酶的功能,如果得到酶的三维 结构信息,对酶的催化机制的研究提供最直接的线索 。获得酶三维结构的方法有X射线衍射和NMR。 (3)定点突变 分子生物学技术的发展使对蛋白质定点突变变的很 容易,所以只要得到一个酶的基因,就可以对其氨基 酸序列进行任意的突变。如果对一个酶氨基酸残基进 行有的放矢的突变,会对酶的作用机制研究提供有价 值的信息。把胰蛋白酶活性中心裂缝底部的Asp189突 变成不带电荷或带正电荷的氨基酸残基,胰蛋白酶活 性完全丧失。胰蛋白酶只水解碱性氨基酸残基与其他 氨基酸氨基形成肽键,所以Asp189通过侧链的负电荷 与底物上的碱性氨基酸残基带正电荷的侧链结合。 (4)动力学分析 动力学分析可以为研究酶的作用机制提供有用的数 据。 (5)化学修饰 用双功能试剂对酶的修饰有助于确定在三维结构上 相邻的基团。借助底物或竞争性抑制剂的保护,可以 通过化学修饰确定活性中心的氨基酸残基的性质。 例:假定一个酶分子上有6个Csy残基,但又无法确 定它的活性中心是否有或者有几个Csy残基,可以分 别在有或无过量底物存在下,用碘代乙酸修饰酶,然 后进行对比,在底物保护的情况下,不能被修饰的 Csy残基就在活性中心。 ΔG活为反应活化能HA-HB-HC为过渡态中间物。过渡态中间物既不是产物,也不是底物,而是介
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