绵羊H-FABP基因单核苷酸多态性的研究.PDF

绵羊H-FABP 基因单核苷酸多态性的研究 1，2 1 1 1 1,3 1 1 1 乔海云 ，赵倩君，姚娜，卢亚洲 ，孟详人 ，韩健林，关伟军，马月辉 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京100193； 2.河北工程大学农学院，邯郸056000； 3.黑龙江省农业科学院畜牧所，哈尔滨 150086 摘要：以小尾寒羊（48只）、宁夏滩羊（121只）、滩寒杂交羊F1 （23只）、无角陶塞特（48只）、萨福克（24 只）5个绵羊群体为实验材料，利用PCR-SSCP和DNA测序技术对心脏型脂肪酸结合蛋白（H-FABP ）基因 (GenBank登录号：AY157617)外显子2和内含子2部分序列进行单核苷酸多态性（SNPs ）检测及遗传多态性 分析。结果表明：（1）引物2 的PCR扩增产物中存在981(G/A)、1014(A/C) 、1019(T/C) 和 1058 (-/G ) 4个SNP 位点，表现为AA 、BB 、CC、AB 、AC 、BC 、AD 、CD和BD 9种基因型，其中AA 为优势基因型。经χ2检验后， 除滩羊和萨福克羊外，其他群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传多态性 分析表明：宁夏滩羊、小尾寒羊和无角陶塞特羊3个群体中的多态信息含量（PIC ）均处于0.25和0.50之间， 为中度多态，萨福克羊和滩寒杂交羊为低度多态（PIC ＜0.25 ），表明脂肪酸结合蛋白基因在不同绵羊品种 中具有单核苷酸多态性, 可以进一步作为候选基因来分析其与肌内脂肪含量性状的关联性。（2 ）引物4 的PCR 扩增产物中检测到1个SNP多态位点为2407(T/C) ，表现为HH 、Hh和 hh 3种基因型，基因型频率大小为HH ＞Hh ＞hh ，经χ2检验后，在滩羊和无角陶塞特羊中均为达到Hardy-Weinberg平衡状态，其多态信息含量均为 低度多态（PIC ＜0.25 ），而在小尾寒羊、滩寒杂交羊F1和萨福克羊均没有多态出现。 关键词：绵羊；心脏型脂肪酸结合蛋白基因；单核苷酸多态性 Study on single nucleotide polymorphisms of H -FABP gene in sheep 1,2 1 1 1 1,3 QIAO Hai-Yun , ZHAO Qian-Jun , YAO Na , LU Ya-ZHou , MENG Xiang-Ren , 1 1 1 HAN Jian-lin ,GUAN Wei-Jun , MA Yue-Hui 1.Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China; 2.College of Agriculture, Hebei University of Engineering, Handan 056000, China; 3. Institute of Animal Science, Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Haerbin 150086, China Abstract: PCR-SSCP and DNA sequencing approaches were applied to assess the single nucleotide polymorphisms (SNPs) and analyze the genetic polymorphisms at partial exon 2 and intron 2 of H-FABP （Heart fatty acid-binding protein ）gene, and five sheep populations that comprised of Small-T