深圳超算HPC使用手册v32.pdfVIP

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2019-01-07 发布于浙江
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深圳超算HPC使用手册v3.2 系统运行部 2015年9月1 日 1 更新记录 2015/8/12-Ver3.1 更新项目更新状态 VPN登陆方式的改变说明。已完成去除龙芯相关内容。已完成排版规划以及内容更新。施工中文档字体规范（暂定）正文字体：微软雅黑三号标题字体：微软雅黑二号 1 标题字体：微软雅黑三号 2 表格字体：微软雅黑五号 2 目录目录3 1. 基本环境5 2. 系统软件环境7 2.1 操作系统7 2.2 作业调度系统7 2.3编译器和并行实现7 2.4 公共软件位置8 3. 使用方法10 3.1 登录和传输文件11 3.1.1VPN登陆11 3.1.2 终端登录12 3.2 编译15 3.3 作业提交16 web 方式提交作业16 命令行方式提交作业19 3.4 作业管理21 附件A.常用的作业提交模板25 3 1 普通串行计算25 2 普通MPI并行作业26 3 多个计算步骤的计算脚本26 4 共享内存(openmp)并行作业28 5OpenMP+MPI 混合并行作业28 6mpich2并行作业(RAW方式)30 附录B ：商用软件使用方法32 1Fluent软件32 2ANSYS软件34 3CFX软件36 4ABAQUS软件38 5MARC软件40 6NASTRAN软件42 7LSDYNA软件44 8DYTRAN软件46 9HFSS软件48 附录C ：技术支持49 4 国家超级计算深圳中心采用由中科院和曙光公司联合研制的曙光6000超级计算系统，该系统整体计算能力实测峰值为1.271千万亿次浮点运算（1.271PFLOPS）。于2011 年11月16日投入运行。本文主要介绍曙光6000超级计算系统的使用方法和环境。 1. 基本环境为了方便管理和使用，曙光6000超级计算系统高性能计算区分成4个逻辑分区可供所有用户使用，用户可以根据不同的业务需求选择适合自己计算类型的分区。分区名 GG分区 GK分区 FN分区 YW分区节点数 960 640 128 520 CPU型号 Intel5650 Intel5650 AMD 6136 Intel5650 CPU核数 12 12 32 12 CPU主频 2.66GHz 2.66GHz 2.4GHz 2.66GHz 内存 24G 24G 128G 48G IB网络 20G 20G 20G 20G 本地硬盘 149G