第三章基上因组学
鸡卵清蛋白基因DNA与其mRNA杂交图 (二)基因家族(gene family) (四)逆转录病毒 1.逆转录病毒一般分类 逆转录病毒可以说就是RNA肿瘤病毒。 第一个被发现的RNA肿瘤病毒是劳氏肉瘤病毒(Rous Sarcoma vivus, RSV, 1911)。至今为止所发现的retro-v都能使动物致癌。 (1)肉瘤病毒 (2)白血病病毒(leuremia virus) (3)乳腺瘤病毒(mammazy tumor virus)和淋巴瘤病毒,如鸟类髓细胞瘤病毒(avian myelocytoma, AMV) (4)人类嗜T细胞逆转录病毒(human T-lymphotropic retro-v, HTLV)HTLV-III现称人类免疫缺陷综合症病毒(human immunodeficiency virus, HIV)或AIDS病毒。 2.逆转录病毒基结构特征 (1)是RNA的复合体 ①2条(+)RNA单体正向平行,携带所有的遗传信息,而且完全相同, 。 ②2条tRNA较小,是宿主tRNA(RSV是tRNAtrp),+RNA对于复制位置是至关重要。 (2)5’端有m7Gppp帽,3’端有Poly(A)尾。 (3)编码区(反式功能区)从5’→3’ 非编码区(顺序功能区,调控区)5’,3’都有 ①gag(groupantigen)编码衣壳蛋 ①R区 逆转录合成cDNA必须区域 ②Pov(Polyrmerase) 逆转录酶 ②PB区 引物结合区 ③env(envelop) 包膜蛋白 ③U区 U3含启动子,U5与转录终止加尾有关 *④ONC(oncogene) 癌基因 ④ψ(包装信号),DLS(氢链结合位点) 如RSV是SRC C为调控区 *有的retro-V有ONC。 3.逆转录病毒生活周期 (1)吸附 可能所有的动物病毒受体都是表面糖蛋白(MLV的受体是左旋氨基酸转运蛋白,受体与基因治疗)。 (2)入胞 逆转录,转录,翻译。 ①逆转录——前病毒基因组(cDNA)的形成 RNA+逆转录酶→宿主胞浆→逆转录→(RNA为模板,+RNA为引物)→cDNA(见第四章)→进入核→随机整合宿主染色体→形成前病毒。(phag仅注入核酸) cDNA形成新的重复(U3-R-U5)称LTR(long terminal repeat 长末端重复顺序)。cDNA含有RNA全部信息且较RNA长。 ②转录——病毒基因组的形成 U3区启动子启动前病毒基因组转录出从5’区至3’R区的RNA。 ③翻译gag、env、pol gag —— 全长RNA能直接作为gag基因mRNA,进行翻译。但有90%的mRNA只译出gag多蛋白质,经肽链加工裂解为衣壳蛋白。 pol —— RNA序列有干扰gag终止码的序列,使约10%mRNA在翻译过程中,直至pol的终止码,经翻译后加工裂解,形成衣壳蛋白,逆转录酶和整合酶(integrase)。 env —— 一部分全长mRNA经过转录后的剪接,使env编码区与病毒RNA5’端帽子连接在一起→env mRNA →包膜糖蛋白。 (3)病毒颗粒成熟←包装← ψ(基因治疗) RNA5’端PB-区与宿主tRNA以氢链相连形成复合体→包装→病毒颗粒。 (4)释放子病毒→感染其它细胞。 4.逆转录病毒引起白血病的3种机理.(以此说明RNA肿瘤病毒的致癌作用与基因组类型.) (1)急性逆转录病毒 (2)慢性逆转录病毒 (3)HTlV(人类嗜T细胞逆转录病毒) ①含onc* ①不含onc ①含tat的HTLV ②可在数周内使培养 ②不能转化,但V感染 ②含使培养细胞转化,机理和1、2不同。 细胞发生转化. 整体动物潜伏数月致癌. ③onc插到宿主DNA中 ③前V整合到proto-onc ③反式调控作用,tot插入→ 去产生致癌mRNA癌基 前,病毒LTR启动子增强 转录mRNA→tat蛋白作用于 因产物转化细胞致癌.子启动增强c-onc表达, TGF-β1等→使细胞增殖永生 改变细胞生长特性. 化。 (五)人类免疫缺陷病毒基因组(HIV) 获得性免疫缺陷综合征(AIDS)1981年在美国首先发现,其病原是一种破坏人免疫系统的retro-V.1986年命名为HIV。
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