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临床基因扩增检验被操作规范
临床基因扩增检验操作规范 ;一、临床基因扩增检验实验室的
规范化设置及其各室的功能
二、各阶段操作要求
三、PCR污染与对策
四、因操作欠规范导致的问题分析
;一、临床基因扩增检验实验室的 规范化设置及其各室的功能; 1. 四个隔开的工作区域中每一区域都须有
专用的仪器设备。
2. 明确的标记,如加样器或试剂等。
3. 单一方向顺序,从试剂贮存和准备区、 标本
制备区、扩增反应混合物配制和扩增区(简
称扩增区)至产物分析区。
4. 使用不同颜色或有明显区别标志的工作服。
5. 实验室的清洁应按试剂贮存和准备区至扩增
产物分析区的方向进行。
6. 各自的清洁用具。; 各室功能:
;(一)试剂贮存和准备区; 含反应混合液的离心管或试管在冰冻前都应快速离心数秒。
戴手套。
工作结束后必须立即对工作区进行清洁。实验台表面,使用可移动紫外灯(254nm波长)照射,一般照射过夜。
实验室及其设备的使用必须有日常记录。 ;(二)标本制备区; 要正确使用加样器。
正压条件避免从邻近区进入本区的气溶胶污染。
为避免样本间的交叉污染,加入待测核酸后,必须盖好含反应混合液的反应管。
对具有潜在传染危险性的材料,必须有明确的样本处理和灭活程序。
用过的加样器吸头必须放入专门的消毒容器内。
用于RNA扩增检测的样本制备好以后,应立即进行cDNA合成。 ;(三)扩增区; 已制备的DNA模板和合成的cDNA的加入和主反应混合液制备成反应混合液等也可在本区内进行。
在巢式PCR测定中,第二次加样必须在本区内进行。
可降低本区的气压以避免气溶胶从本区漏出。
如有加样则应在超净台内进行。
打开反应管前快速离心数秒。
;(四)扩增产物分析区; 膜上微孔板上探针杂交方法、 Southern转移、琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、核酸测序方法等。
本区是最主要的扩增产物污染来源。溴化乙锭、丙烯酰胺、甲醛或同位素等有毒或致癌物质,注意实验人员的安全防护。
负压条件。
;二、各阶段操作要求;(一)标本的采集;(二)标本的稳定化处理;(三)标本的运送;(四)标本的贮存;(五)标本的处理(核酸提取); 操作时(加裂解液后充分混匀,沸水浴)
注意:
①离心管不能插得过低,以防进水;
②水浴时不能加盖,防管盖爆开;
③水浴时间须准确,10±1 min;
④水浴时不能走开;
⑤左右手分开,左手只接触样本,右手只接触加样器及操作仪器。;(六)靶核酸的逆转录(RT)和扩增;RT-PCR操作注意:;(七)扩增产物的分析;实时荧光定量PCR;TaqMan荧光定量PCR原理;
;Evaluation only.
Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0.
Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;三、PCR污染与对策;要防止PCR污染,必须做好以下3个环节的工作:
(一)污染的预防
(二)污染源的追踪
(三)污染源的处理
;(一)污染的预防;3、改进实验操作:
(1) 带一次性手套;
(2) 避免反应液的飞溅;
(3) 用一次性移液器或吸头,吸头不要暴露于
空气,以免产物气溶胶污染;
(4) 操作多份样品时,要先将可混匀的成分
(dNTPs,缓冲液,引物等)一起制备标准
混合液(Master mix);
(5) 制备反应混合液时,最后加入样品DNA,
加入DNA后,在进行下一步操作前要盖紧
反应管。
4、检查结果的可重复性。;(二)污染源的追踪
;1、阳、阴性对照;2、常见的环境污染源有 ;追踪可疑的环境污染源;(三)污染源的处理
;1. 环境污染处理法;2. 反应液的污染处理法;(2) 内切酶法:
选择识别四个碱基的内切酶(如MspI等),最好几种合用,可克服其识别序列特异的缺陷。方法同上,只是DnaseI由内切酶(M
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