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华南特殊生境植物的遗传多样性研究-生物化学与分子生物学专业论文
中山大学硕士学位论文
中山大学硕士学位论文 华南特殊生境植物的遗传多样性研究
条,多态位点百分率(D为96.3%,期望杂合度(堤)为0.305;表明桐花树具 有较高的遗传多样性,这与桐花树木本、多年生、混交等生活史特征以及广泛的 地理分布相符。在种群水平上,户为8.56%~84.24%(平均为26.21%)全部13 个种群的遗传分化系数(岛)为0.6727,基因流(Nm)0.122。表明桐花树种群 问有很高的遗传分化,基因流很小,要保存其遗传多样性,需要采样多个种群。 基于Nei遗传距离的UPGMA聚类图表明中国、泰国、斯里兰卡和澳大利亚四个国 家桐花树种群独立分开,四地种群有较大的遗传差异。AMOVA分析表明泰国种群 中遗传变异有51.77%存在于泰国马来半岛东、西海岸间,28.46%存在于地区内 不同种群问,19.77%存在于各种群内。泰国马来半岛东、西海岸种群间的差异可 能与历史地理事件、气候、地理隔离、洋流等因素有关。
采用cpi基因对杯萼海桑的亲缘地理学研究表明,杯萼海桑在物种水平上的 基因多样性h=0.7796,居群水平上的核苷酸多样性n=0.005635,显示了较低的 遗传多样性。Fst值为O.9159接近于1,表明绝大多数遗传变异存在于居群间, 仅有少量(不到10%)遗传变异分布在居群内。Mentaltest结果表明,遗传距离 和地理距离之间几乎没有相关性。单倍型分析检测到8个单倍型,大部分不同国 家之间的居群存在着强烈的遗传分化。
关键词:遗传多样性,遗传结构,亲缘地理学,特殊生境
中山戈学硕士学位论文
中山戈学硕士学位论文 华南特殊生境植物的遗传多样性研究
Genetic diversity of plants in special habitats of South China
Major:Biochemistry and Molecular Biology Name:Xiaowei Ni
Supervisor:Prof.Suhua Shi
Abstract
Primulina tabacum Hance,is a critically endangered perennial endemic to limestone area in South China.Genetic variability within and among four extant populations of this species was assessed using AFLP markers.We expected low genetic diversity level of this narrowly distributed species,but our results revealed that hi【gh level of genetic diversity remains,both at population level(55.5%of
markers polymorphic,HE=0.220,/s=0.321),and at species level俨=85.6%of markers polymorphic,HE=0.339,IS=0.495),probably resulting from its refugial history and/or breeding system.High levels of genetic differentiation among populations was apparent based on Nei’S genetic diversity analysis(Gst=0.350).The restricted gene flow between populations is potential reason for the hi曲genetic differentiation.The population genetic diversity of P tabacum revealed here has clear implications for
conservation and management.To maintain present levels of genetic diversity,in situ conservation of all populations is necessary.
A.corniculatum,belongs to Aegiceras,Myrsinaceae,w
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