重组和转座32.pptVIP

第一节 重组的分类 一、?同源重组或普遍性重组： Recombination involving reaction between homologous sequences of DNA is called generalized or homologous recombination. 依赖于参与重组的DNA分子在序列上的广泛一致性； 同源性重组可以发生在两条同源DNA上的任何位点； 经常发生于减数分裂期的同源染色体之间。 二、位点特异性重组 Site-specific recombination?(Specialized recombination) 这种重组的特点是重组发生在特异位点，此位点含有短的同源序列,供位点特异性重组酶识别(如 λ噬菌体DNA整合到寄主DNA)； 重组DNA的其它区域不具有同源性 三、转座： refers to the movement of a transposon to a new site in the genome. A transposon?(transposable element) is a DNA sequence able to insert itself (or a copy of itself) at a new location in the genome, without having any sequence relationship with the target locus. 转座分为复制型、非复制及保守型三种类型 四、模板选择（copy choice）性重组 适用于RNA病毒，在这种重组中，聚合酶从一个模板转换到另一个模板来合成RNA，结果新合成的分子将含有两个不同亲本的遗传信息 第二节 同源重组 一、Holliday连接： 在同源染色体的相同位点产生切口 两条染色体的DNA链发生交叉 切口封闭，形成holliday junction (或chi结构) Branch migration（分枝迁移） 在两对同源链的其中任意一对上产生切口，拆分中间体 二、Rec BCD途径 －同源重组的酶学机制 Rec BCD蛋白同时具有解螺旋酶的活性，使chi位点附近切口的DNA解链 单链区被Rec A蛋白和SSB蛋白覆盖 RecA 蛋白使单链DNA取代双链DNA中的同源部分 D－loop区域的DNA产生切口，新切口的3’端（ the tail of newly nicked DNA ）与另一条DNA的单链区互补配对 DNA连接酶封闭切口，形成Holliday junction RuvA 和RuvB发动迁移反应 RuvC拆分重组中间体 第三节 转座（transposition）一、原核转座子的类型 1.插入序列（insertion sequences , IS）: IS家族的结构： 短的正向重复序列（direct repeats, DR） 略长的反向重复序列（inverted repeats，IR） 1kb左右的编码区，仅编码和转座有关的转座酶。 对靶位点的选择有三种形式：随机选择，热点选择和特异位点的选择。 Insertion sequences have inverted terminal repeats and generate direct repeats of flanking DNA at the target site. ?2.复合转座子 (Composite transposons )： 含有一个中心序列和位于两侧的臂（arm）； 除了和自身转座有关的基因外，中心序列含有抗药性基因等遗传信息； 复合转座子两端的臂由IS序列组成。 A composite transposon has a central region carrying markers (such as drug resistance) flanked by IS modules. 3.Tn A家族: TnA是复制型转座的转座子，长约5kb左右 。 两端具有末端反向重复序列（而不是IS），长约38bp左右，任一个缺失都会阻止转座。 中部的编码区编码三个基因：转座酶，解离酶和抗性基因， TnA家族都带有抗性标记 。 靶位点具有5bp的正向重复序列。 解离位点（res）是TnA家族特有的内部位点。 二．转座机制： 根据转座子的机制，转座可分成三种不同的类型 1． 复制型转座 (replicative transposition)： Replicative transposition describes the movement of a transposon by a mechanism in which first it is re