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氨基酸与肽
t5-3 ? 多肽/蛋白质具有 特定的氨基酸组成 (by hydrolysis) - 酸水解将使Asn/Gln 转化为Asp/Glu,而 Trp的吲哚环则会被 氧化破坏 - 碱水解会不同程度地 破坏多数AA并产生 消旋混合物 - 酶水解不破坏AA或 产生消旋,但因专一 性所限而需要多种酶 协同作用 t5-4 ? 有些蛋白质具有非氨基酸化学基团 结合蛋白可依据其辅基分类 5-16 ? 蛋白质具有高级层次结构 - 纤维蛋白的特性一般在二级结构上即可表现出来 - 球蛋白的生物学功能往往需要以三级结构形式来实现 - 酶等特殊球蛋白大多要在四级结构层次上才能表达其活性 (covalent bond) (hydrogen bond) (3D for a peptide) (3D for more peptides) (cf. Fig. 2-27) 自学 ? 生物活性肽具有重要的生理功能 谷胱甘肽Glutathione(oxidative) 胰岛素Insulin(hexomer) 阿斯巴甜Aspartame (cf. p30~) 要点提示 ⑴ 蛋白质由20种标准?-AA组成,不同AA的性质差异取决 于其R侧链的不同,并可依据其极性以及在生理pH条件 下的荷电状态而分为中性脂肪族、芳香族、极性不带电 荷、带正电荷(碱性)和负电荷(酸性) AA等类别 ⑵ 除Gly外,所有标准?-AA的C?都是不对称的,故至少 具有两种不同的立体构型,但在天然蛋白中都是L-型 异构体;非标准AA则往往是游离的代谢中间物或是 标准AA的衍生物 ⑶ 单氨基单羧基的简单AA在低pH条件下为二元酸型阳离 子,其羧基随着pH的增加失去质子而形成电中性的兼性 离子(是为等电点pI),进一步加大pH将导致其氨基失去 质子而形成负离子;带有可解离R侧链的AA的荷电状态 则取决于溶液pH及其pK值 要点提示 (续1) ⑷ AA的氨基、羧基和R侧链的某些基团可进行特征性化学 反应;茚三酮反应可用于AA的定性定量测试,DNFB、 DNS-Cl和PITC等则常用于测定肽链的N-端残基 ⑸ AA可以经由肽键共价连接形成肽链/蛋白质;细胞通常 含有数以千计的功能及生物学活性均不相同的蛋白质; 蛋白质可以是由成百上千个残基组成的多肽链,也可以 是仅由少量残基构建的寡肽链;简单蛋白质的水解只生 成AA,复合蛋白质则含有其它非AA组分 ⑹ 蛋白质结构可分为四个层次;初级结构为AA序列以及二 硫键连接;二级结构是相邻残基形成的局部空间分布; 三级结构为整条多肽链呈现的3D构象;四级结构则涉及 到稳定连接的多条多肽链/亚基所形成的特定空间联系 一、选择 3, 5, 7, 8, 16, 17 二、填空 1, 7, 8, 15 三、判断 1~4, 9 四、判断 2, 5, 6, 8, 11, 15 五、问答与论述 3, 12 复习题 (考研精解 p16~20) 作 业 1) 组成蛋白质的20种AA中,哪些是极性的?哪些是非极性的?哪一种 不能参与形成真正的肽键?为什么? 2) 将固体AA溶解于pH 7的水中所得的溶液,有的pH7,有的pH7, 这种现象说明了什么? 3) 根据Asp的解离常数(p20,表2-1): a) 图示其随溶液pH由酸至碱变化过程中的解离状态; b) 在pI时它处于哪种解离态? c) 计算其pI值 4) Gly是由乙酸甲基上的H被一个氨基取代而成的,但其羧基的pKa要比 乙酸羧基的pKa更低,为什么? 5) 与乳腺释放乳汁有关的催产素是一种九肽激素: Cys-Phe-Ile-Glu-Asn-Cys-Pro-His-Gly-NH2, 两个Cys之间以二硫键相连 。试计算当pH为2.0, 8.5和10.7时,该九 肽的净电荷分别是多少?(已知N-末端Cys的游离氨基pKa为10.7, Glu侧连羧基的pKa为4.07,His侧连咪唑基的pKa为6.0;二硫键在 上述pH条件下均稳定,而且C-末端羧基已被酰胺化。) There are three other amino acids that are incorporated directly into proteins at the ribosome. Each uses a codon otherwise used by
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