DNA条形码在篮子鱼科鱼类种类鉴定和系统进化分析中的应用.PDFVIP

第 15 卷第 1 期 南    方    水    产    科    学 Vol.15，No.1 2 0 1 9 年 2 月 South  China  Fisheries  Science Feb. ，2019   doi: 10.12131 • 研究简报 •   DNA 条形码在篮子鱼科鱼类种类鉴定和系统进化分析中的应用 1, 2 1 1 1, 3 1 1 1, 3 闫亚利 ，张    楠 ，郭华阳，郭    梁 ，朱克诚，刘宝锁，张殿昌 （1. 中国水产科学研究院南海水产研究所，农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室，广东 广州 510300； 2. 上海海 洋大学水产与生命学院，上海 201306； 3. 广东省海洋生物种业工程技术研究中心，广东 广州 510300） 摘要： 为建立篮子鱼科鱼类物种快速鉴定方法，该研究扩增获得了篮子鱼科 10种鱼类的46条线粒体CO Ⅰ基因 序列，结合从BOLD和GenBank上筛选出的12种27条篮子鱼科CO Ⅰ基因序列，分析篮子鱼科鱼类的CO Ⅰ基 因片段序列特征、种间和种内遗传距离及分子系统进化关系。结果表明，19种73条篮子鱼科CO Ⅰ基因序列的 平均碱基组成为T：28.9%、C：28.7%、A：24.6%、G：17.8%。G+C 的含量 (46.5%)低于A+T 的含量 (53.5%)，碱基组成表现出明显的偏倚性；篮子鱼科鱼类的种间平均遗传距离为0.098，是种内平均遗传距离 (0.002) 的49倍；基于19种篮子鱼科鱼类的CO Ⅰ序列的系统进化分析结果显示，19种篮子鱼中仅单斑篮子鱼 (Siganus unimaculatus)和狐篮子鱼(S. vulpinus)聚类在一起，形成 1个分支，剩余 17种(89.5%)篮子鱼相同种内 个体各自聚为一支，形成 17个独立的分支。结果表明基于CO Ⅰ基因的DNA条形码技术可应用于篮子鱼科物种 鉴定。 关键词： 篮子鱼科；CO Ⅰ基因；DNA条形码 中图分类号： Q 959                      文献标志码： A                      文章编号： 2095 − 0780 − （2019）01 − 0100 − 06 Species identification and phylogenetic relationship in Siganidae based on DNA barcoding 1, 2 1 1 1, 3 1 1 1, 3 YAN Yali , ZHANG Nan, GUO Huayang, GUO Liang , ZHU Kecheng, LIU Baosuo, ZHANG Dianchang (1. Key Laboratory of South China Sea Fishery Resources Exploitation Utilization, Ministry of Agriculture and Rural Affairs ; South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China; 2. College of F