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cDNA微阵列检测水稻幼苗空间特异表达基因.pdf

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农业生物技术学报 Journal of Agricultural Biotechnology 2003,11 6冤院 582~587 ·研究论文· cDNA 微阵列检测水稻幼苗空间特异表达基因* 亮先 董海涛 庄晓峰 张 峰 李德葆** (浙江大学生物技术研究所,杭州 310029 ) 摘要:以含有2 200 个独立水稻转录本的膜质cDNA 微阵列鉴别萌发期水稻( L. )幼苗的空间特异表达基因。 经比较表达 ,得到了在胚芽、胚轴和胚根中特异表达的基因分别为31、36 和73 个。其中,胚轴特异表达基因包括聚泛蛋白、 UDP- 葡萄糖焦磷酸酶、蔗糖合酶、磷酸甘油酸激酶等参与糖、蛋白质代谢反应的蛋白,意味着在萌发期水稻幼苗中,胚乳贮藏 淀粉和贮藏蛋白的降解反应主要发生在胚轴部。实验检测到的胚芽和胚根特异表达基因包括一些具有防御功能的基因及多个 参与复制、转录和翻译过程的基因, 如胚芽特异表达的基因中,翻译起始因子5a、40s 核糖体蛋白s28 及核糖体蛋白l36 与蛋白 ; 、 ,肽 合成有关 而过敏性蛋白 -D- 葡聚糖外水解酶和肌动蛋白-11 等为抗病相关基因。胚根特异表达的基因中 链延伸因子 1-琢 、TATA 盒结合蛋白、DNA 复制蛋白A2 、组蛋白和两种核糖体蛋白等与复制、转录和翻译有关;而富含甘 酸蛋白、创伤 、 、脂类转运蛋白 。通过分析这些 诱导性碱性蛋白 Bowman-Birk 蛋白酶抑制因子 -2 等基因则与幼苗的防卫反应有关 空间特异表 达基因,揭示出一些潜在的生物学规律,为研究萌发生理学提供了有价值的信息。 : ; ;表达;基因 关键词 水稻 cDNA 微阵列;萌发 Identifying the Spatial Specifically Expressed Genes in Rice ) Seedlings by Using cDNA Microarray Sun Liangxian Dong Haitao Zhuang Xiaofeng Zhang Feng Li Debao** (Institute of Biotechnology, Zheji ang University, Hangzhou 310029,China ) Membranous rice cDNA microarrays containing 2200 unique rice transcripts were used for identifying spatial specifically expressed genes in germinating

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