影响α-螺旋稳定性的因素.pptVIP

11208210 范霖 α-螺旋的定义 α-螺旋的功能 α-螺旋的特征 影响α-螺旋形成及稳定 性的因素 α-螺旋的定义 蛋白质中常见的一种二级结构，肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状，一般都是右手螺旋结构，螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基（第n个）的羰基氧与多肽链C端方向的第4个残基（第n＋4个）的酰胺氮形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中，螺距为0.54nm，每一圈含有3.6个氨基酸残基，每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。 α-螺旋的功能 　　α-螺旋在DNA结合基序（DNA binding motifs）中有非常重要的作用，比如在锌指结构，亮氨酸拉链，螺旋-转角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。这是因为α-螺旋的直径为1.2nm,正好和B-DNA大沟的直径相等，所以能够和B型DNA紧密结合。 α-螺旋的特征 （1）α-螺旋结构是一个类似棒状的结构。肽链围绕其长轴盘绕成右手螺旋体。 （2）α-螺旋每圈包含3.6个氨基酸残基，螺距为0.54nm，即螺旋每上升一圈相当于向上平移0.54nm。相邻两个氨基酸残基之间的轴心距为0.15nm，每个残基绕轴旋转100°。 （3）α-螺旋结构的稳定主要靠链内的氢键维持。 影响α-螺旋形成及稳定的因素 　　一条肽链能否形成α螺旋，以及螺旋的稳定性怎样，与其一级结构有极大关系。 R基小且不带电荷，易形成α-螺旋。 存在空间位阻 同种电荷的互斥效应 不能形成氢键 侧链构象不稳定 影响α-螺旋形成及稳定的因素 存在空间位阻 极大的侧链基团是影响α螺旋稳定性的第一大因素。 较大的氨基酸残基的R侧链集中的区域，不利于α螺旋的生成。 同种电荷的互斥效应 连续存在的侧链带有相同电荷的氨基酸残基是影响α螺旋稳定性的第二大因素。 带相同电荷的侧链，使两个单体之间发生同电荷互斥的现象。因此连续酸性或碱性氨基酸存在时，也不利于α螺旋的生成。 不能形成氢键 Pro等亚氨基酸存在是影响α螺旋稳定性的第三大因素。 脯氨酸由于其亚氨基少一个氢原子，无法形成氢键，而且Cα－N键不能旋转，所以是α螺旋的破坏者，肽链中出现脯氨酸就中断α螺旋，形成一个“结节”。因此，脯氨酸或羟脯氨酸残基存在时，同样不能形成α螺旋。 甘氨酸的存在是影响α螺旋稳定性的第四大因素。 甘氨酸由于侧链太小，构象不稳定，也是α螺旋的破坏者。 侧链构象不稳定 * * * *