Site-occupancy模型在物种分布研究中的应用-北京生态学会.PDFVIP

Site-occupancy模型在物种分布研究中 的应用 陈国科 北京生态学学会2012年年会 2012.12.12 内容 一、提出问题 二、Site-occupancy模型 三、研究案例 四、主要结论 一、提出问题 物种地理分布调查中的负样本（0 ）： 1）物种不存在 2 ）物种存在，但未被发现、记录 rbinom(10, 1, 0.95) [1] 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 生物学过程和调查过程 自然历史和生态条件 ψ 物种分布或不分布 z ~ Bernoulli (ψ) p 见到或未见到 y | z ~ Bernoulli (z ×p ) 调查结果＝ 生物学过程 × 调查过程 忽视调查过程的后果 1）低估物种占有的地点数量 rbinom(10,1,0.8) [1] 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 2 ）错误地将影响调查过程的环境变量确定为 影响物种分布的因素 Site-occupancy模型 取样策略：重复调查（MacKenzie et al. 2002; Tyre et al. 2003） 010 L(ψ, p ) = ψ× (1-p )2 ×p 000 L(ψ, p ) = ψ× (1-p )3 + (1- ψ) Site-occupancy模型 Site 1 Site 2 Site N 0…10 1…00 1…11 T：调查次数 n ：发现物种的地点数 nt ：第t次调查时发现物种的地点数 N −n ⎡ n T n n−n ⎤ ⎡ T ⎤ t − t × − + − L (ψ,p ) ψ p (1 p ) ψ (1 p ) (1 ψ) ⎢ ∏ ⎥ ⎢ ∏ ⎥ ⎣ t 1 ⎦ ⎣ t 1 ⎦ （MacKenzie et al. 2002, 2006） 9 0 0 2