第3章+生物信.pptVIP

第3章 生物信息的传递——转录;转录（Transcription）：是以DNA为模板在酶的作用下合成RNA的过程，是基因表达的第一步，也是关键的一步。由ＲＮＡ聚合酶催化，以ATP、UTP、CTP、GTP为底物。 同DNA的合成一样，RNA的合成也是有方向的，沿着５’→3’的方向合成。 ;;● 某一基因只以一条单链DNA 为模板进行转录;顺着起点，RNA聚合酶沿着模板移动合成RNA，直到到达终止子序列。 一个转录单元可以包括好几个基因。;启动子;3.1.1 转录的基本过程;转录的基本过程;3.1.2 转录机器的主要成分3.1.2.1 RNA聚合酶 ;全酶由核心酶和σ因子组成;全酶由核心酶和σ因子组成;全酶由核心酶和σ因子组成;σ因子;α亚基：促使RNApol与DNA 模板链上游转录因子结合，位于前端的α因子使双链解链为单链，位于尾端的α因子使单链新聚合为双链 β因子：促进RNApol+NTP→RNA延伸（DNA/RNA杂合链） β’因子：促使RNA polymerase与非模板链（sense strand）结合 σ因子：识别特异的启动子序列，使全酶与启动子结合;全酶（Holo Enzyme）的五个功能位点 ;原核生物RNApol (Core) 的结构与功能;RNA聚合酶包围着转录泡;二 真核生物的RNA聚合酶;细胞器中的RNA聚合酶;;;snRNA和scRNA;;3.1.2.1 转录复合物;3.2 启动子与转录启始3.2.1启动子区的基本结构;一 原核生物的核心启动子;原核生物的核心启动子;二 真核生物的启动子;RNA聚合酶I启动子（I型启动子）;RNA聚合酶II启动子（II型启动子）;Cap site：initiation point (+1) ，即转录起始位点，多数情况下为A，两边多是嘧啶。在转录出20～30nt时，转录体5’端会连接上N7-甲基鸟苷酸（m7G），结果就成了 Capping m7GpppA/G------70 ±---AUG---(in mRNA);真核生物基因的基本结构;;RNA聚合酶III启动子（III型启动子）;3.2.2 启动子区的识别;3.2.3 酶与启动子区的结合;3.3 转录延伸;RNA 聚合酶在延伸阶段之前要经过好几种状态。 一开始全酶结合其上形成闭合的二元复合物（-35区）； 后来DNA“熔解”，就转变成开放的二元复合物（-10区）； 合成RNA后，转变成三元复合物； RNA合成了8-9nt之后，σ因子被释放（用于下一个转录，重复使用），RNA开始不断合成。 ;接触→结合→熔解; Model of the interaction between E. coil RNA polymerase holoenzyme and a promoter. ;σ因子的循环;σfactor can be reused;4. RNA链开始合成 RNA聚合酶将DNA链打开，形成开放的二元复合物；然后吸引第一个核苷酸与DNA结合，几乎所有的起始位点都是嘌呤（通常是A）。 当RNA长约9nt时，形成稳定的“DNA·聚合酶·RNA”三元复合物；此时，RNA聚合酶还没有沿着DNA移动。 在RNA合成9～10nt之前，三元复合物并不稳定，RNA聚合酶随时有可能从DNA链上掉下来；但当RNA合成9～10nt以上时，σ因子离去，三元复合物变得很稳定。 σ因子的离去是RNA起始与延伸的分水岭，而σ因子又可与另一个核心酶结合，重新开始下一轮转录。;5. RNA链的延伸 在转录过程中，正被解旋的DNA形成转录泡，大小约17bp，随聚合酶的移动而移动。 在转录过程中，RNA聚合酶起着形成转录泡、按照碱基互补配对原则吸引NTP、在RNA3’-OH端连接上新的核苷酸、在转录泡的5’端将解旋的DNA重新缠绕为双螺旋等作用。;RNA聚合酶包围着转录泡;3.5 RNA链的终止及抗终止 3.5.1 RNA 链的终止 所有原核生物的终止子在终止之前都有一个回文结构，其产生的RNA能形成茎环结构（发夹结构）。即RNA能够自身互补，从而能够形成一个茎和环的稳定的结构（茎上通常富含GC）。这种RNA的发夹结构通常是转录的终止信号。当合成发夹RNA以后，RNA的转录就停止。 当RNA与模板分离后，聚合酶区域的反义链与有义链复性，最后RNA聚合酶从DNA链上解离下来。 终止效率取决于由对称序列所构成的“茎”的牢固程度。;需要终止的DNA序列通常都位于终止子序列之前。转录的终止通常都需要有RNA发夹结构的形成。;原核生物中的终止子;不依赖于ρ因子的终止子的结构特征;不依赖于ρ因子的终止;依赖ρ的终止子的结构特征;依赖于ρ因子的终止子： ρ因子;rut 位点;ρ因子依赖型的终止;3.5.2 抗终止;Ancillary factors bi