新药发现和发展的新途径：天然产物的生物合成和组合生物合成研究.ppt

新药发现和发展的新途径： 天然产物的生物合成和组合生物合成研究 刘 文 生命有机国家重点实验室 中国科学院上海有机化学研究所，枫林路354号，200032 2005.10.30 2005年中国微生物学会学术年会： Nat. Prod. Rep. 2005, 22, 162-195; J. Nat. Prod. 2004, 67, 2141-2153; J. Nat. Prod. 2003, 66, 1022-1037; J. Nat. Prod. 1997, 60, 52-60 天然化合物（1％） 新型药物（24-40％） 新药发展的主要来源：天然产物 Anticancer and Antibacterial Drugs: ~ 70%; 2000 ~ 2003: 15 New Natural Product-Derived Drugs Lunched and 15 Natural Product- Derived Compounds in Phase III Clinical Trails or Registration. 以天然产物为基础发展药物的方法 获得新型结构和生物活性 的抗生素变得越来越难 一. 自然分离 合成步骤繁多 合成产率低下 二. 化学合成 以微生物作为“细胞工厂”，通过对代谢途径的遗传控制，生物合成所需要的新型药物。 以微生物为对象研究生物合成的优势 微生物产生大量具有生物活性的次生代谢产物； 易于培养、生长迅速、代谢旺盛，适合采用发酵的方法大量积累代谢产物； 遗传背景相对简单，细胞内DNA重组技术手段相对成熟。 0.0 2.5 5.0 7.5 10.0 12.5 15.0 17.5 20.0 22.5 (kb) Structure Gene Resistance Gene Regulatory Gene 天然底物 吸收 合成 天然代谢产物 输出 调节 环境因素 ＋ _ 代谢途径 酶催化反应 天然产物的次生代谢（生物合成）途径 信号传导 竞争拮抗 环境适应 抗性和耐药机制 微生物生物化学问题： 次生代谢途径存在哪些生化反应？ 生化反应的酶学机制是什么？ 生化反应如何协作参与抗生素形成？ 微生物遗传学问题： 连续的酶催化反应如何调控？ 生物体如何逃避抗生素对自身的伤害？ 插入 置换 缺失 药物 组合生物合成基因库 重组微生物库 “非天然”天然 化合物库 生物合成基因簇 不同来源的生物合成基因 微生物 组合生物合成： 次生代谢途径的遗传修饰与化学结构的多样性 PCR获得PKS或NRPS基因片段 突变株 遗传转移系统 探针 发酵检测 基因文库 生物合成基因簇的克隆 酶学反应、调控和抗性机制等 次生代谢生物合成途径的建立 代谢途径的遗传修饰 应用于新药发现和发展 组合生物合成 微生物学 分子生物学 遗传学、生物化学和化学 研 究 策 略 出发点！ 核心！ 应用！ 目标！ 目前拟开展研究的课题： 新型聚酮和聚肽类抗生素的次生代谢生物合成研究 Nacathiacin: Anti-bacteria Sanglifehrin A: Immunosuppressant Tetrocarcin A: Anti-tumor Chlorothricin 1: Anti-bacteria Azinomycin B: Anti-tumor Saframycin A: Anti-tumor 例一：聚酮类Spirotetronate抗生素的生物合成研究 Produced by Streptomyces antibioticus Tü 99; Antibiotic activity: against gram-positive bacteria (Inhibitor of pyruvate carboxylase); Cholesterol biosynthesis inhibition. Produced by Micromonospora Chaldea KY 11091; * Anticancer Activity * Antibacterial Activity 以T-ALL和B-CLL肿瘤模型的细胞凋亡实验表明，TC-A可能诱导一条新的细胞信号传导途径。 PKS聚酮类： E2 A3 A4 A5 A6 E3 L M D1 D2/