动物标记辅助基因聚合优化体系研究动物遗传育种与繁殖专业论文.docxVIP

＼1哪Y㈣1m9帆3mm2帆9帆3帆3哪 ＼1哪Y㈣1m9帆3mm2帆9帆3帆3哪 本研究由 国家“十一五’’科技支撑计划项目 (2006BAD01A11) 国家自然科学基金项目(No 国家现代农业产业技术体系肉羊体系岗位科学 家经费 资助 Funded by National Key Technology RD Program(No．2006BAD01A1 1) National Natural Science Foundation of China (No．3 0972094) National Modem Agricultural Industry Technology Fund for Scientists in Sheep Industry System． 独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。 独创性声明 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。 尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰 写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用 过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明 并表示了谢意。 ～躲彷凌孑 帆舻∥月沙日 关于论文使用授权的声明 本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科学 院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或 扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体 上发表、传播学位论文的全部或部分内容。 (保密的学位论文在解密后应遵守此协议) 蝴糍才忿象冱时删卜∥∥日 聊虢矛堋咖纱／哪 论文题目 论文题目 动物标记辅助基因聚合优化体系研究 动物遗传育 论文作者 徐凌洋 专业 研究方向 分子数量遗传学 种与繁殖 指导教师 杜立新 培养单位(研究所、中心) 北京畜牧兽医研究所 评 博导口 ‘＼ 硕(博) 姓名 职称 单 位 专业 签名 导师 硕导口 硕导口 ＼ 硕导口 ‘＼ 阅 博导口 人 博导口 答 辩 硕导口 动物遗传育 j‰ 主 张勤 教授 博导日 中国农业大学 种与繁殖 席 晓 博导日 种与繁殖 豸船 孙东 硕导口 动物遗传育 教授 中国农业大学 硕导口 ．-,11／ 蔡宏 教授 北京大学 免疫学 钐易 博导日 答 王立 硕导口 动物遗传育 贤 研究员 博导d 北京畜牧兽医研究所 种与繁殖 多方斧 辩 韩建 硕导口／ 动物遗传育 林 研究员 博导囱 北京畜牧兽医研究所 种与繁殖 饷砖砟 委 储明 研究员 硕导口 北京畜牧兽医研究所 动物遗传育 修懈 员 星 博导函 j 种与繁殖 李俊 硕导囱 动物遗眵 勤仅舷 ，一， 研究员 北京畜牧兽医研究所 雅 博导口 种与繁殖 l 会议记录(秘书) 张莉聃、、 I 论文答辩时间地点 畜牧所科研楼二楼小会议室 摘 摘 要 动物基因聚合育种是通过世代选择，向一个理想个体中聚合来源不同群体的多个目标基 因型，进而实现生产培育出具有超级经济性状动物个体的目标。本研究受进化计算的启发， 首先，将基冈聚合育种过程等同于优势基冈型组合的优化过程。本研究模拟混合群体和杂交 群体．卜．基因聚合，同时，基T—MATLAB GUI开发了动物基因聚合模拟软件AGPBSim，主要 研究结果如下： 1．混合群体的基因聚合研究 本研究以混合群体为基础群体，标记辅助选择配组亲本，以基因聚合为目标设计优化方 案，选择聚合最优的基因型组合。聚合的目标基因为主要效应的基因，个体基因型通过二项 式字符串模拟，子代基冈犁由亲代基因型离散重组产生，个体表犁值由基因型．表犁模型预 测。分别计算各个世代群体的海明距离，优势基因型频率和平均表犁值作为聚合进展的综合 衡量标准。本研究设计二种选择策略，基因型选择、简单表型选择和整合基冈信息的表型选 择，比较运用不同选择策略下的基因聚合育种进展。基因型选择中考虑混合群体的初始基因 频率，在表型选择中，基冈型．表型模型整合了性状遗传力，基因犁效应和基冈互作效应信 息。同时，本研究以聚合四个目标基因为例，模拟不同混合群体和不同选择策略下聚合四个 目标基因的聚合进展。本研究结果表明选择模型显著地影响聚合育种进程。 2．杂交群体基因聚合的研究 本研究针对不同目标基因聚合个数和动物分离群体的特征，设计四类杂交方案——两群 体杂交、三群体杂交、四群体级联杂交和四群体对称杂交。在各个方案中，首先，进行基因 型选择九个世代，分析和比较不同基因频率和基础群体规模下聚合育种进程。其次，在相同 的杂交方案中，比较基因型选择和表型选择策略，分析不同杂交组合，性状遗传力，初始基 因频率，基础