大头鳕TNFSF6基因的结构分析及其在发育早期和病毒暴发时.PDFVIP

大头鳕TNFSF6基因的结构分析及其在发育早期和病毒暴发时.PDF

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大头鳕TNFSF6基因的结构分析及其在发育早期和病毒暴发时.PDF

第43 卷 第 2 期 水 产 学 报 Vol. 43, No. 2 2019 年 2 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA Feb., 2019 文章编号: 1000-0615(2019)02-0523-09 DOI: 10.11964/jfc.20171010995 大头鳕TNFSF6基因的结构分析及其在发育早期和 病毒暴发时的表达水平 1 1 1,2* 1 1 刘瑞婷 , 蒋洁兰 , 毛明光 , 姜志强 , 布尔特 , 1 1 1 矫志伟 , 陈明康, 孙 谦 (1. 大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室, 辽宁省北方鱼类应用生物学与增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023 ; 2. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,湖北 武汉 430072) 摘要:为揭示大头鳕TNFSF6基因的基本结构与功能及其在大头鳕发育和神经坏死病毒 (Pacific cod nervous necrosis virus, PCNNV)暴发时的响应机制,本研究通过基因克隆获得 TNFSF6 cDNA 开放阅读框序列,并对序列进行生物信息学分析,运用相对荧光定量 PCR(qRT-PCR)方法对TNFSF6在不同组织、孵化后不同日龄仔鱼和PCNNV 感染前后仔稚 鱼中的表达水平进行检测。结果显示,大头鳕TNFSF6 cDNA长1 388 bp ,5′UTR 占315 bp ,3′UTR 占500 bp ,ORF全长573 bp ,编码190个氨基酸。qRT-PCR结果显示,TNFSF6 在各组织均有表达,但在脾脏和鳃组织中的表达量较高;大头鳕孵化后15、20、37和40 d TNFSF6基因的转录水平分别是其在5 d 转录水平的0.28 、0.15 、0.12 和0.13倍。在24 d 和46 d PCNNV暴发时,病鱼TNFSF6基因的转录水平高于对照组;在77 d PCNNV暴发 时,病鱼TNFSF6转录水平则显著低于对照组。研究表明,TNFSF6基因在大头鳕发育早 期和仔鱼暴发PCNNV 时发挥了重要的作用。 关键词: 大头鳕;肿瘤坏死因子;TNFSF6 ;发育;神经坏死病毒 中图分类号: S 941. 99 文献标志码: A 肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF) , 可与同源受体结合形成相关的信号复合物,激 [ 1] 活多种信号通路,如NF-κB 、JNK 、MAPKs等, 最初由Carswell等 发现,因该蛋白能引起肿瘤 [5-6] 组织出血性坏死,因而被称为肿瘤坏死因子。在 引起细胞凋亡 。TNFSF是重要的炎症因子,具 人类中,已有19种肿瘤坏死因子超家族(TNF 有诱导靶细胞增殖和凋

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