生物信息学 引言.pptVIP

* Bioinformatics 生物信息学 从人类基因组计划（HGP）说起 曼哈顿原子弹计划 阿波罗登月计划 人类基因组计划 自然科学史上的三大计划” 曼哈顿原子弹计划 美国陆军部于1942年6月开始实施的利用核裂变反应来研制原子弹的计划 顶峰时期曾经起用了53.9万人 总耗资高达25亿美元 历时3年，1942年6月开始实施1945年7月15日凌晨5点30分，世界上第一颗原子弹试验成功 8月6日和9日，美国分别在日本的广岛和长崎投下了原子弹 阿波罗登月计划 是美国从1961年到1972年从事的一系列载人登月飞行任务。 历时约11年，始于1961年5月，至1972年12月第6次登月成功结束 耗资255亿美元 在工程高峰时期，参加工程的有2万家企业、200多所大学和80多个科研机构，总人数超过30万人。 60年代初，美国总统Kennedy提出两个科学计划： ?登月计划 ?攻克肿瘤计划 为什么提出HGP？ 第一个自由生物体流感嗜血菌(H. inf)的全基因组测序完成 1996 完成人类基因组计划的遗传作图 启动模式生物基因组计划 H.inf全基因组 Saccharomyces cerevisiae 酿酒酵母 Caenorhabditis elegans 秀丽线虫 1997 大肠杆菌(E.coli)全基因组测序完成 1998 完成人类基因组计划的物理作图 开始人类基因组的大规模测序 Celera公司加入，与公共领域竞争 启动水稻基因组计划 大肠杆菌及其全基因组 水稻基因组计划 1999.7 第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度 2000 Celera公司宣布完成果蝇基因组测序 国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基 因组的测序工作 2000.6.26 公共领域和Celera公司同时宣布完成人类基因组工作草图 2001.2.15 《Nature》刊文发表国际公共领域结果 2001.2.16 《Science》刊文发表Celera公司及其合作者结果 Drosophila melanogaster 果蝇 Arabidopsis thaliana 拟南芥 2001年2月15日《Nature》封面 2001年2月16日《Science》封面 Sanger测序法 大规模基因组测序 大规模测序基本策略 逐个克隆法：对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装（公共领域测序计划） 全基因组鸟枪法：在一定作图信息基础上，绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序，利用超级计算机进行组装（美国Celera公司） 鸟枪法 运用计算机软件进行序列拼接 人类基因组构成——24条染色体和线粒体 人类基因组构成——24条染色体和线粒体 我国对人类基因组计划的贡献 功能基因组学 HGP即将完成，我们即将进入“后基因组学”(post-genomics)时代 基因组学研究重心已开始从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究上,即功能基因组学（functional genomics） 功能基因组学的研究内容 进一步识别基因，识别基因转录调控信息，分析遗传语言。 注释所有基因产物的功能，这是目前基因组功能注释的主要层次。 研究基因的表达调控机制，研究基因在生物体代谢途径中的地位，分析基因、基因产物之间的相互作用关系，绘制基因调控网络图。 比较基因组学研究，在基因组水平对各个生物进行对照比较，可以揭示生命的起源和进化、发现蛋白质功能。 蛋白质结构与功能关系的研究 蛋白质结构 蛋白质序列 蛋白质功能关系 基于生物信息学的新药设计 *