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家蚕分子遗传连锁图的构建及其应用.PDF
家蚕分子遗传连锁图的构建
及其应用
黄勇平
中国科学院上海生命科学研究院
植物生理生态研究所
昆虫发育与进化生物学重点实验室
2011年11月29 日
家蚕基因组的背景信息
Genome size 470Mb
Mutants 1000
Chrom. number 28
Genes identified 500
Shotgun sequence: Jap. 3 X
China 6 X
所有的工作都需要从头开始
丰富的家蚕遗传资源-Egg
1000个品种＋800个突变基因
丰富的家蚕遗传资源-Larvae
丰富的家蚕遗传资源-Pupae
丰富的家蚕遗传资源-Adult
国内外已有的同类研究
(1995-2005)
经典 RAPD RFLP AFLP
分子标记及图谱构建
Robot 33P-CACACA 显影
Enzymes
杂交
DNA
大造 Sau3AI 250,000 CA: 5400
Tsp509I clones CT: 8200
Primer
Genotyping Polymorphism design Sequence
T G T A T A C A T
518 loci 大造 C108 Primer F: 4000 C G T T G
780个多态 Primer R: 3000 30000
获得了2670个家蚕SSR标记
26个SSR标记
31个家蚕品系
Li et al., Genome, 2005 服务于家蚕资源平台
Genotyping
Parents: P50 and C108
P50 X C108
F1
C108M X Female Male X C108 F
Marker cluster Recombination rate
BC1F BC1M
构建了家蚕SSR遗传连锁图
Miao et al., PNAS, 2005,102(45):16303-16308.
遗传连锁图谱的主要特
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