养猪微生物发酵床垫料细菌多样性分析-环境科学学报.PDFVIP

第 ３８卷第 １２ 期 环　 境　 科　 学　 学　 报 Ｖｏｌ．３８，Ｎｏ．１２ ２０１８年１２月 　Ａｃｔａ Ｓｃｉｅｎｔｉａｅ Ｃｉｒｃｕｍｓｔａｎｔｉａｅ Ｄｅｃ．，２０１８ ＤＯＩ：１０．１３６７１／ｊ．ｈｊｋｘｘｂ．２０１８．０３００ 陈倩倩，刘波，王阶平，等．２０１８．养猪微生物发酵床垫料细菌多样性分析［Ｊ］．环境科学学报，３８（１２）：４７５１⁃４７５９ Ｃｈｅｎ Ｑ Ｑ，Ｌｉｕ Ｂ，ＷａｎｇＪ Ｐ，ｅｔ ａｌ．２０１８．Ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｌｉｔｔｅｒｓｉｎｍｉｃｒｏｂｉａｌｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎｂｅｄｆｏｒｐｉｇ⁃ｒａｉｓｉｎｇ ［Ｊ］．ＡｃｔａＳｃｉｅｎｔｉａｅＣｉｒｃｕｍｓｔａｎｔｉａｅ，３８ （１２）：４７５１⁃４７５９ 养猪微生物发酵床垫料细菌多样性分析 ∗ 王阶平，车建美，朱育菁，张海峰 陈倩倩，刘波 ， 福建省农业科学院农业生物资源研究所，福州３５０００２ 收稿日期：２０１８⁃０６⁃０４　 　 　 修回日期：２０１８⁃０７⁃１４　 　 　 录用日期：２０１８⁃０７⁃１４ 摘要：为揭示养猪微生物发酵床垫料细菌群落的多样性，明确发酵程度对垫料细菌群落结构的影响．本研究基于高通量测序技术分析了微生物 发酵床３个发酵等级垫料的细菌群落特征．测序共获得 １１９８４６７条序列，包括３３个门、７３纲、２７２科，６００属的细菌，发酵床垫料细菌多样性与 发酵等级相关．其中中度发酵垫料细菌数量最多，深度发酵垫料细菌种类最多．拟杆菌门、变形菌门、放线菌门和厚壁菌门是优势菌类群．随着发 酵等级的增加，垫料中的葡萄球菌科和皮杆菌科细菌含量减少，说明发酵床可以抑制致病菌，保护养殖健康．在３个发酵阶段，微生物发酵床中 报 起主要降解作用的细菌不同．在轻度发酵时期，黄单胞杆菌科和间孢囊菌科细菌是主要的降解菌群；在中度发酵时期，变形菌门的腐螺旋菌科、 拟杆菌门的黄杆菌科、放线菌门的棒状杆菌科和异常球菌⁃栖热菌门的特吕珀菌科起主要降解作用；在深度发酵时期，厚壁菌门梭菌目瘤胃菌 科、拟杆菌门的紫单胞杆菌科、变形菌门的产碱菌科和假单胞菌科起降解作用．随着垫料等级的增加，粪便中的指示菌———瘤胃菌含量增加，可 作为垫料更换的信号．ＰＩＣＲＵＳｔ分析显示随着发酵等级增加，细菌代谢水平下降．本研究可为发酵床猪粪的生物降解提供理论依据，同时为发酵 床垫料的管理与维护提供参考． 学 关键词：微生物发酵床；细菌多样性；高通量测序；发酵等级 文章编号：０２５３⁃２４６８（２０１８）１２⁃４７５１⁃０９　 　 　 中图分类号：Ｘ１７２，Ｘ８３５　 　 　 文献标识码：Ａ Ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｌｉｔｔｅｒｓ ｉｎ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｂｅｄ ｆｏｒ ｐｉｇ⁃ｒａｉｓｉｎｇ ∗ 学 ＣＨＥＮ Ｑｉａｎｑｉａｎ，ＬＩＵ Ｂｏ ，ＷＡＮＧＪｉｅｐｉｎｇ，ＣＨＥ Ｊｉａｎｍｅｉ，ＺＨＵ Ｙｕｊｉｎｇ，ＺＨＡＮＧ Ｈａｉｆｅｎｇ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｂｉｏ⁃ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｆｕｊｉａｎ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｆｕｚｈｏｕ ３５０００２ Ｒｅｃｅｉｖｅｄ４ Ｊｕｎｅ２０１８；　 　 　 ｒｅｃｅｉｖｅｄ ｉｎ ｒｅｖｉｓｅｄ ｆｏｒｍ １４ Ｊｕｌｙ ２０１８；　 　 　 ａｃｃｅｐｔｅｄ １４ Ｊｕｌｙ ２０１８ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅｍａｉｎｏｂｊｅｃｔｉｖｅｏｆ ｔｈｉｓｓｔｕｄｙ ｉｓｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓｉｎｌｉｔｔｅｒｓｆｒｏｍｍｉｃｒｏｂｉａｌｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎｂｅｄ （ＭＦＢ），ａｎｄｔｏｒｅｖｅａｌｔｈｅ 科 ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｂａｃ