链霉菌中高效生产聚酮化合物的研究方法及进展.pdf

微生物学报 Acta Microbiologica Sinica 2016, 56(3): 418-428 /actamicrocn DOI: 10.13343/ki.wsxb Review 综述 链霉菌中高效生产聚酮化合物的研究方法及进展 * 姚永鹏，王为善，杨克迁 中国科学院微生物研究所，微生物资源前期开发国家重点实验室，北京 100101 摘要： 聚酮化合物是通过聚酮合成途径产生的一大类结构和生物活性多样的次级代谢产物，是链霉菌产 生的主要次级代谢产物，具有重要的经济价值。为了在链霉菌中提高聚酮化合物产量，以满足工业生产 需求，近年来，代谢工程的方法被广泛应用，例如，过表达合成途径中限速酶或途径特异性激活蛋白、 强化前体供应、去除产物反馈抑制、合成基因簇异源表达等。本文将从代谢工程改造实例入手，全面综 述链霉菌中聚酮化合物高效生物合成的研究方法及进展，并对利用合成生物学策略智能动态适配各个相 关途径，进而提高该类化合物产量的研究思路进行展望。 关键词：链霉菌, 聚酮, 代谢工程, 产量, 合成生物学 聚酮化合物是通过聚酮合成途径产生的一大 PKS是一个多功能酶复合体，只含有一套可重复 类结构和生物活性多样的次级代谢产物。链霉菌 使用的独立蛋白，在聚酮合成过程中，这些蛋 及与其亲缘关系相近的放线菌是发酵工业中聚酮 白被多次重复地用来催化相同的聚酮碳链缩 [1] [ 8 ] 类化合物的主要生产菌株 。聚酮化合物按照聚 合反应 ，例如具有抗细菌活性的放线紫红素 酮合酶(polyketide synthases ，PKSs)结构以及合成 (actinorhodin ，Act)[9] 、具有抗癌活性的道诺霉素 机制的不同，可以分为3大类：I型聚酮，PKS是 (daunorubicin ，DNR)[10] 和阿霉素(doxorubicin ， 以模块形式存在的多功能酶，每一模块含有非重 DXR)[11]等均由II型PKSs合成；III型聚酮，PKS与 复使用的催化功能域，这些非重复使用的催化功 前两种PKS截然不同，它是一个同源二聚体多功 [2] 能，线性化地完成聚酮合成的起始和延伸 ，例 能酶，聚酮合成所有催化反应均在同一个单体的 如具有抗细菌活性的红霉素(erythromycin)[3–4] 、免 活性位点完成，合成前体直接以辅酶A 形式提 疫抑制活性的雷帕霉素(rapamycin)[5] 、抗真菌活性 供，不需要酰基载体蛋白(acyl carrier protein ， 的两性霉素(amphotericin)[6] 、杀虫活性的阿维菌 AC