植物NRT2家族的分子进化-江苏农业学报.PDF

江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci. ),2015,31(1):45~54 http:/ / 45 钱摇 瑜,察倩倩,孔摇 敏,等. 植物NRT2家族的分子进化[J].江苏农业学报,2015,31(1):45鄄54. doi:10.3969/ j.issn.1000鄄4440.2015.01.007 植物NRT2 家族的分子进化 1 2 1 3 1 1 1 钱摇 瑜 ,摇 察倩倩 ,摇 孔摇 敏 ,摇 刘照坤 ,摇 李摇 英 ,摇 侯喜林 ,摇 刘同坤 (1.南京农业大学园艺学院/ 作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏 南京 210095; 2.南京农业大学食品科技学院,江苏 南京 210095; 3.苏州市蔬菜研究所,江苏 苏州 215008) 摇 摇 摘要:摇 为了研究硝酸盐转运子NRT2家族在植物中的进化关系,综合利用共线性信息和序列相似性信息,从 8种已经进行过全基因组测序的物种(大白菜、大豆、杨树、葡萄、玉米、水稻、高粱、二穗短柄草)中,搜索拟南芥 NRT2 的同源基因。 通过分析发现,这些基因序列基本都具有MFS超家族的NNP家族基因的典型特征。 但单、双 子叶植物之间,NRT2 的基因结构存在着较大的差异。 系统发育重建结果表明,NRT2基因家族的成员主要是在单、 双子叶植物分歧后进化产生的;同时,不同植物的NRT2基因又具有不同的进化模式。 大白菜NRT2 家族经历了基 因组三倍化事件及基因片段丢失。 因此,拟南芥和大白菜的NRT2家族有较为密切的进化关系,进化分析为利用已 有的拟南芥NRT2研究结果进一步在大白菜中开展NRT2 的功能研究提供了参考线索。 关键词:摇 NRT2; 共线性; 序列分析; 进化 中图分类号:摇 S601摇 摇 摇 文献标识码:摇 A摇 摇 摇 文章编号:摇 1000鄄4440(2015)01鄄0045鄄10 Molecular evolution of NRT2 gene family in plant 1 2 1 3 1 1 1 QIAN Yu ,摇 CHA Qian鄄qian ,摇 KONG Min ,摇 LIU Zhao鄄kun ,摇 LI Ying ,摇 HOU Xi鄄lin ,摇 LIU Tong鄄kun (1.College of Horticulture/ StateKey Laboratory of Crop Genetics and GermplasmEnhancement,NanjingAgricultural University,Nanjing210095,China; 2.College of Food Science and Technology,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China; 3.Suzhou Institute of Vegetable Science,Suzhou 215008,China) 摇 摇 Abstract:摇 In order to study the evolutionary relationship ofNRT2 family of nitratetransportersinplants,synteny a鄄 nalysis approach andsequence similaritywereusedtoidentify putativeorthologuesofArabidopsisNRT2 genesinother eight fully sequencedgenomes (Chinesecabbage,soybean,westernpoplar,grapevine,maize,rice,sorghum,andpurplefalse brome). Sequenceanalysisrevealsthatt